14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1072 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1072  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  530  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.042495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2518  Nucleotidyltransferase, predicted  71.26 
 
 
257 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0207586  hitchhiker  0.00121784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1902  hypothetical protein  53.18 
 
 
273 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0481  Nucleotidyltransferase, predicted  45.93 
 
 
260 aa  209  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3808  hypothetical protein  42.91 
 
 
266 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6191  hypothetical protein  33.99 
 
 
241 aa  85.1  1e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0053  nucleotidyltransferase-like protein  32.64 
 
 
237 aa  65.5  9e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0028  uncharacterized protein, YcgL-like protein  34.09 
 
 
336 aa  60.8  2e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  28.69 
 
 
256 aa  53.9  3e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  29.89 
 
 
254 aa  53.5  3e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  30.95 
 
 
364 aa  50.4  3e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  26.14 
 
 
280 aa  49.3  6e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0390  hypothetical protein  33.9 
 
 
326 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.525134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  29.22 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>