More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1054 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
313 aa  629  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  87.42 
 
 
302 aa  535  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  81.06 
 
 
313 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  80.73 
 
 
311 aa  497  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  80.55 
 
 
310 aa  485  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  77.88 
 
 
323 aa  482  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  78.48 
 
 
306 aa  477  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  75.97 
 
 
309 aa  472  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  76.74 
 
 
318 aa  471  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  76.16 
 
 
309 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.66 
 
 
308 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  74.59 
 
 
328 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  74.03 
 
 
324 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.33 
 
 
308 aa  455  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  73.27 
 
 
312 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.47 
 
 
323 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.81 
 
 
342 aa  428  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  70.19 
 
 
332 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1708  aspartate carbamoyltransferase  69.02 
 
 
335 aa  425  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  66.77 
 
 
349 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.21 
 
 
337 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  67.08 
 
 
327 aa  412  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  67.07 
 
 
351 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1325  aspartate carbamoyltransferase  65.43 
 
 
333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.23 
 
 
315 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.43 
 
 
319 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  68.2 
 
 
310 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.58 
 
 
315 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2404  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.73 
 
 
316 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  66.45 
 
 
318 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2363  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.73 
 
 
316 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0607904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2410  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  68.73 
 
 
316 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14730  aspartate carbamoyltransferase  65.05 
 
 
320 aa  391  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  65.58 
 
 
316 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5245  aspartate carbamoyltransferase  67.43 
 
 
311 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.81 
 
 
312 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  56.6 
 
 
319 aa  341  9e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.1 
 
 
318 aa  339  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  57.86 
 
 
320 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  56.11 
 
 
313 aa  335  5e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.19 
 
 
313 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  56.03 
 
 
312 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.82 
 
 
310 aa  331  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.1 
 
 
308 aa  331  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.82 
 
 
310 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  52.33 
 
 
311 aa  330  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  55 
 
 
313 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.49 
 
 
307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.15 
 
 
318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.69 
 
 
311 aa  325  7e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  54.79 
 
 
306 aa  324  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.07 
 
 
311 aa  322  7e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  52.35 
 
 
307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.25 
 
 
313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.01 
 
 
306 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.93 
 
 
335 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.04 
 
 
311 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3200  aspartate carbamoyltransferase  53.64 
 
 
314 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.35 
 
 
307 aa  317  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  50.34 
 
 
309 aa  316  4e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.22 
 
 
334 aa  315  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  51.85 
 
 
312 aa  314  9.999999999999999e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  54.05 
 
 
326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.84 
 
 
310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.69 
 
 
308 aa  312  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
313 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
313 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
313 aa  311  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.83 
 
 
307 aa  311  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.08 
 
 
316 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.37 
 
 
336 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.86 
 
 
312 aa  309  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  54.18 
 
 
309 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  51.16 
 
 
312 aa  309  4e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.17 
 
 
310 aa  309  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.43 
 
 
316 aa  309  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.36 
 
 
313 aa  309  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.88 
 
 
317 aa  308  5.9999999999999995e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  52.67 
 
 
314 aa  308  6.999999999999999e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.1 
 
 
315 aa  308  8e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0814  aspartate carbamoyltransferase  52.82 
 
 
311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0244425  normal  0.140169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.36 
 
 
317 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.03 
 
 
311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.44 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0602  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.7 
 
 
316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.56 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0924  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.19 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.44 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  53.31 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.22 
 
 
317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1092  aspartate carbamoyltransferase  51.16 
 
 
316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000013953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3992  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.48 
 
 
318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  50.17 
 
 
313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3061  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.59 
 
 
341 aa  302  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.280506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.81 
 
 
310 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.79 
 
 
316 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1425  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.7 
 
 
325 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  54.03 
 
 
320 aa  300  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>