More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1044 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  100 
 
 
391 aa  757    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  64.19 
 
 
393 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  57.14 
 
 
382 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  58.12 
 
 
372 aa  362  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  52.92 
 
 
388 aa  343  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  51.8 
 
 
375 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  48.59 
 
 
404 aa  327  3e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  47.56 
 
 
392 aa  293  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  47.87 
 
 
384 aa  280  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  50.81 
 
 
368 aa  262  8.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  43.08 
 
 
374 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  45.68 
 
 
385 aa  249  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  38.28 
 
 
454 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  42.57 
 
 
349 aa  235  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  43.57 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  45.07 
 
 
375 aa  226  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  43.97 
 
 
401 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  39.45 
 
 
450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  40.41 
 
 
395 aa  210  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  40.1 
 
 
440 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  38.67 
 
 
405 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  38.34 
 
 
411 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  40.11 
 
 
371 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  44.54 
 
 
389 aa  189  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  38.12 
 
 
410 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  40.22 
 
 
378 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  38.62 
 
 
388 aa  186  7e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  38.55 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  32.01 
 
 
367 aa  182  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  33.42 
 
 
356 aa  182  8.000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  40.17 
 
 
376 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  34.62 
 
 
1033 aa  178  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  39.89 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  37.33 
 
 
402 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  39.31 
 
 
389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  38.12 
 
 
406 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  38.92 
 
 
335 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  34.82 
 
 
652 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  36.83 
 
 
360 aa  171  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  29.05 
 
 
365 aa  170  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  35.73 
 
 
371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  37.5 
 
 
340 aa  163  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 
379 aa  163  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  33.52 
 
 
367 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  40.62 
 
 
338 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  38.66 
 
 
342 aa  159  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  31.87 
 
 
666 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  34.48 
 
 
371 aa  159  8e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  39.42 
 
 
376 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  39.42 
 
 
376 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  33.42 
 
 
368 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  32.69 
 
 
367 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  31.59 
 
 
666 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  30.49 
 
 
652 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  35.03 
 
 
355 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  33.52 
 
 
375 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  33.63 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  31.95 
 
 
684 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  37.85 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  37.85 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  37.85 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.36 
 
 
369 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  30.17 
 
 
417 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.33 
 
 
417 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.69 
 
 
386 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.09 
 
 
369 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  35.57 
 
 
361 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.36 
 
 
369 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  39.94 
 
 
342 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  34.57 
 
 
371 aa  143  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  38.24 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  28.01 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.72 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  27.73 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 
419 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  31.97 
 
 
361 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  27.45 
 
 
369 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
377 aa  136  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  27.37 
 
 
369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  27.37 
 
 
369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  27.5 
 
 
369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
376 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  27.17 
 
 
369 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  27.17 
 
 
369 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  26.82 
 
 
369 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  26.94 
 
 
369 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  26.89 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  31.96 
 
 
372 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  29.43 
 
 
371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  29.43 
 
 
371 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  29.43 
 
 
371 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.43 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 
381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  28.88 
 
 
371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  28.88 
 
 
371 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.88 
 
 
371 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  29.13 
 
 
371 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  28.88 
 
 
371 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>