More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0994 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  72.98 
 
 
459 aa  676    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
459 aa  912    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.55 
 
 
459 aa  675    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0944  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.08 
 
 
458 aa  718    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0941075  normal  0.125714 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0936  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.49 
 
 
459 aa  650    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.05659  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.78 
 
 
463 aa  631  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.59 
 
 
461 aa  618  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.45 
 
 
466 aa  617  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.43 
 
 
459 aa  607  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0595207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.35 
 
 
461 aa  598  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3134  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.05 
 
 
460 aa  600  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.011293  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.88 
 
 
461 aa  597  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2304  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.47 
 
 
459 aa  596  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3551  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.25 
 
 
462 aa  591  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3319  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 
481 aa  585  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1780  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.84 
 
 
460 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00606157  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2100  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.86 
 
 
460 aa  567  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.243913  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1606  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.8 
 
 
460 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.24 
 
 
460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0020481  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3278  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.08 
 
 
477 aa  560  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.355374  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.44 
 
 
456 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4469  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.06 
 
 
455 aa  548  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4300  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.06 
 
 
455 aa  548  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.943446  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4200  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.06 
 
 
455 aa  548  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10500  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.52 
 
 
457 aa  545  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.115157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1865  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.93 
 
 
458 aa  529  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  decreased coverage  0.000152881 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16340  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.66 
 
 
458 aa  529  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0637268  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13320  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.09 
 
 
459 aa  510  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00904125  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1863  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.59 
 
 
469 aa  473  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16430  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.61 
 
 
467 aa  463  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 
465 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.86 
 
 
470 aa  356  5.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.85 
 
 
466 aa  350  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.79 
 
 
468 aa  344  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.27 
 
 
462 aa  342  5.999999999999999e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.99 
 
 
471 aa  340  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  41.65 
 
 
464 aa  340  4e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.38 
 
 
473 aa  339  5e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.22 
 
 
473 aa  338  8e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.39 
 
 
465 aa  338  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 
473 aa  335  9e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 
473 aa  335  9e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 
473 aa  335  9e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 
473 aa  335  9e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 
473 aa  335  9e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 
473 aa  335  9e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.92 
 
 
473 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 
473 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.52 
 
 
473 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.52 
 
 
473 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.31 
 
 
473 aa  332  6e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.08 
 
 
463 aa  326  5e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.7 
 
 
467 aa  325  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.05 
 
 
471 aa  325  9e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.2 
 
 
467 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.39 
 
 
463 aa  324  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.35 
 
 
463 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.27 
 
 
467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.77 
 
 
467 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
467 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.35 
 
 
581 aa  317  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  37.34 
 
 
462 aa  317  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.46 
 
 
470 aa  317  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.78 
 
 
462 aa  315  9e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.57 
 
 
465 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.27 
 
 
468 aa  315  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.51 
 
 
480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
467 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.36 
 
 
471 aa  312  7.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 
471 aa  312  9e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.09 
 
 
465 aa  311  1e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.26 
 
 
465 aa  311  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.75 
 
 
470 aa  310  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.69 
 
 
459 aa  310  5e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.73 
 
 
483 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.35 
 
 
463 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.61 
 
 
462 aa  309  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.66 
 
 
476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.53 
 
 
480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
476 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.39 
 
 
464 aa  307  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2446  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  39.15 
 
 
472 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.39 
 
 
465 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.66 
 
 
476 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.77 
 
 
476 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.66 
 
 
476 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.66 
 
 
476 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.77 
 
 
476 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.77 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.77 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.18 
 
 
467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.04 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.63 
 
 
477 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.56 
 
 
476 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
474 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.88 
 
 
466 aa  303  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.58 
 
 
465 aa  303  5.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.21 
 
 
458 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>