More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0951 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  100 
 
 		 68 aa  134  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  62.12 
 
 		 68 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  59.09 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  56.06 
 
 		 68 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  57.58 
 
 		 68 aa  82  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  60.29 
 
 		 70 aa  78.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  56.52 
 
 		 71 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  71.21 
 
 		 67 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  57.58 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  52.94 
 
 		 69 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  57.58 
 
 		 70 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  53.73 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  60.66 
 
 		 68 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 69 aa  74.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  61.54 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  54.41 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  56.52 
 
 		 76 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  59.65 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  52.24 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  60.34 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  53.12 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  59.42 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  52.11 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  58.33 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  60.34 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  59.09 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  52.31 
 
 		 71 aa  67  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 67 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  55.07 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  51.52 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  54.1 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  47.76 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 		 70 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  58.73 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  47.06 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  52.31 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  51.56 
 
 		 839 aa  60.5  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  50.79 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  50.79 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  44.93 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  51.43 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  40 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  42.19 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  52.73 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  45.59 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  43.94 
 
 		 976 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  47.14 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 		 73 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  44.62 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  42.03 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  38.57 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  41.27 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  38.57 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  47.54 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  44.93 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  44.93 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  44.93 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  40.3 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  50.72 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  40.58 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  43.66 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  38.81 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  42.42 
 
 		 1196 aa  53.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  45.9 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  40.58 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  40.58 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  40.58 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  40.58 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  35.94 
 
 		 69 aa  52  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1877  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.186242  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 		 807 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  40.58 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  41.94 
 
 		 560 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 1013 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 1040 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>