34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0904 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0904  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  443  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2634  hypothetical protein  67.93 
 
 
190 aa  244  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0586  hypothetical protein  62.5 
 
 
197 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883676  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2484  hypothetical protein  62.43 
 
 
212 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4819  hypothetical protein  63.69 
 
 
202 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  33.33 
 
 
345 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2309  hypothetical protein  32.47 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1537  hypothetical protein  34.97 
 
 
205 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.516137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0245  hypothetical protein  35.59 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2268  shikimate kinase  32.68 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2135  hypothetical protein  32.68 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2079  hypothetical protein  32.68 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2267  P-loop ATPase protein  33.96 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  30.48 
 
 
197 aa  79  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1644  hypothetical protein  32.45 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1644  hypothetical protein  32.32 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5015  hypothetical protein  31.91 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.549407  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1993  P-loop ATPase protein  33.11 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1242  hypothetical protein  32.68 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0977  hypothetical protein  33.06 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.518817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1736  hypothetical protein  31.79 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.679061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1722  hypothetical protein  31.79 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0819  putative ATP-ase  32.35 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2638  putative ATP-ase  31.76 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2639  P-loop ATPase  26.06 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6356  hypothetical protein  32.26 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0250  hypothetical protein  29.83 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0720  putative ATP-ase  27.56 
 
 
198 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  26.51 
 
 
544 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3695  hypothetical protein  32.08 
 
 
186 aa  45.1  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  29.19 
 
 
523 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  28.57 
 
 
523 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  27.5 
 
 
497 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1816  adenylylsulfate kinase  30.11 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.910917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>