More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0888 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0888  ketoacyl reductase  100 
 
 		 355 aa  706    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.94 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0340631  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.43 
 
 		 366 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.642345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 		 347 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.95 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 		 340 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 		 344 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0147442  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 		 340 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 		 351 aa  212  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00330  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.69 
 
 		 329 aa  209  6e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.6279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 		 323 aa  186  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.31 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0123285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0441783  normal  0.700268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.99 
 
 		 267 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3481  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.17 
 
 		 259 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 256 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 256 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 256 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.72 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.9 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 		 257 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  30.89 
 
 		 236 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.92 
 
 		 240 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0400117  normal  0.51074 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  31.89 
 
 		 254 aa  103  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.39 
 
 		 259 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  30.85 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  33.16 
 
 		 254 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 		 250 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 240 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 240 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 		 247 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  36.32 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 256 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0964408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 269 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  30.55 
 
 		 441 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  32.62 
 
 		 258 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  32.62 
 
 		 258 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.78 
 
 		 246 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.81 
 
 		 238 aa  99.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 		 252 aa  99.4  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.39 
 
 		 252 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 		 262 aa  99.4  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 264 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.32 
 
 		 246 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.95 
 
 		 245 aa  99  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 		 252 aa  99  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  30.48 
 
 		 258 aa  99  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 252 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.91 
 
 		 246 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  32.8 
 
 		 256 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 241 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.91 
 
 		 246 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  33.51 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  31.16 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 		 240 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.89 
 
 		 261 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 257 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 251 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 		 244 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  31.16 
 
 		 267 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  31.16 
 
 		 267 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  31.16 
 
 		 267 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.27 
 
 		 293 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  32.82 
 
 		 264 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 		 258 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 		 260 aa  97.1  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0429  short chain dehydrogenase  30.57 
 
 		 267 aa  97.1  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 		 244 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 269 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 		 246 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 		 244 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.84 
 
 		 252 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>