108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0886 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0886  catalase  100 
 
 
302 aa  618  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1848  Catalase  77.81 
 
 
301 aa  464  1e-130  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  0.135263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2836  Catalase  56.38 
 
 
284 aa  327  1e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0774925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1600  Catalase  52.41 
 
 
316 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1876  manganese containing catalase  52.63 
 
 
292 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20670  Mn-containing catalase  54.31 
 
 
289 aa  283  2e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0815  Catalase  51.92 
 
 
308 aa  276  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.683068  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0221  Catalase  48.77 
 
 
286 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0517  Catalase  43.09 
 
 
290 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1680  Catalase  42.11 
 
 
290 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0606  catalase  46.27 
 
 
297 aa  222  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6390  catalase  48.19 
 
 
274 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3979  catalase  46.99 
 
 
274 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819277  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5296  Catalase  42.65 
 
 
287 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.201236 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5807  Catalase  46.94 
 
 
275 aa  214  2e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12571  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1447  manganese containing catalase  43.54 
 
 
270 aa  210  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2898  Catalase  41.88 
 
 
285 aa  199  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.808431  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2775  catalase  41.88 
 
 
285 aa  197  1e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3002  Catalase  41.88 
 
 
285 aa  197  1e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0705397  normal  0.0852902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2075  catalase  41.82 
 
 
285 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1821  catalase  42.35 
 
 
295 aa  190  3e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  0.0328704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1877  Catalase  42.01 
 
 
303 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11980  Mn-containing catalase  37.2 
 
 
321 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2882  Mn-containing catalase  39.29 
 
 
308 aa  142  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2914  catalase, Mn-containing  38.97 
 
 
287 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3134  catalase, Mn-containing  38.97 
 
 
284 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3134  catalase, Mn-containing  38.46 
 
 
284 aa  141  1e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2123  catalase, Mn-containing  38.78 
 
 
284 aa  141  1e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1673  catalase  36.59 
 
 
277 aa  141  2e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.849273  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2839  manganese containing catalase  38.46 
 
 
287 aa  141  2e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1316  Catalase  40.1 
 
 
294 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  37.56 
 
 
421 aa  139  5e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  32.31 
 
 
290 aa  139  5e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47080  Mn-containing catalase  33.46 
 
 
291 aa  137  3e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  36.54 
 
 
324 aa  135  7e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1858  catalase  30.58 
 
 
292 aa  134  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.724494 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1863  catalase  30.94 
 
 
292 aa  134  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.958813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1921  catalase  30.58 
 
 
292 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0512858  hitchhiker  0.000184673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  31.9 
 
 
276 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1597  catalase  30.58 
 
 
292 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.577365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1415  catalase  30.29 
 
 
292 aa  133  4e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.449813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  34.78 
 
 
326 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  35.03 
 
 
224 aa  130  2e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  32.3 
 
 
294 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5037  Catalase  35.27 
 
 
310 aa  129  7e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2044  Catalase  32.03 
 
 
290 aa  129  8e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  1.98818e-07 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0952  Catalase  37.62 
 
 
302 aa  128  9e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684232  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0729  manganese containing catalase  35.78 
 
 
298 aa  128  1e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  1.23231e-11 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1645  catalase  30.23 
 
 
296 aa  128  1e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  36.41 
 
 
291 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5095  catalase  35.92 
 
 
293 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2783  manganese containing catalase  38 
 
 
296 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00681002  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0681  manganese containing catalase  37.56 
 
 
297 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400648  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  34.83 
 
 
205 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4798  catalase  32.03 
 
 
300 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137059 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5945  manganese containing catalase  34.4 
 
 
304 aa  121  1e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995052  normal  0.0254671 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2997  Mn-containing catalase  32.68 
 
 
314 aa  121  1e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  34.85 
 
 
231 aa  122  1e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  4.26374e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1348  DNA mismatch endonuclease  32.68 
 
 
298 aa  121  2e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30931  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4409  catalase  30.89 
 
 
303 aa  120  2e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3122  Mn-containing catalase  32.68 
 
 
298 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6253  catalase  33.02 
 
 
304 aa  118  1e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5251  catalase  33.8 
 
 
301 aa  118  1e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1578  catalase  33.02 
 
 
304 aa  118  1e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1142  manganese containing catalase  34.31 
 
 
298 aa  118  1e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0584316 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5520  catalase  31.25 
 
 
308 aa  118  1e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6729  catalase  33.02 
 
 
301 aa  118  1e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  35.86 
 
 
293 aa  118  2e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5727  manganese containing catalase  35 
 
 
304 aa  114  2e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.388852  hitchhiker  0.00719162 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  33.33 
 
 
228 aa  114  2e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  3.43768e-09 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  33.87 
 
 
227 aa  114  2e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2165  Catalase  35.9 
 
 
189 aa  113  4e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4224  manganese containing catalase  32.57 
 
 
307 aa  113  4e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0292992  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4741  manganese containing catalase  32.11 
 
 
307 aa  112  8e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4594  manganese containing catalase  32.11 
 
 
307 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.756991  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0376  manganese containing catalase  30.22 
 
 
249 aa  111  1e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3115  manganese containing catalase  34.01 
 
 
299 aa  111  2e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2781  manganese containing catalase  30.47 
 
 
260 aa  110  4e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3157  Mn-containing catalase  35.62 
 
 
249 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0656  manganese containing catalase  33.67 
 
 
189 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.807783  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5292  manganese containing catalase  33 
 
 
304 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0651334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0895  cotJC protein  33.67 
 
 
189 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.60321e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1620  manganese containing catalase  31.01 
 
 
230 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266489 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4479  cotJC protein  32.65 
 
 
189 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.163427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0967  cotJC protein  32.65 
 
 
189 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.89969e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0899  cotJC protein  32.65 
 
 
189 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.71221e-44 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0716  manganese containing catalase  32.65 
 
 
189 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.21736e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0803  spore coat-associated protein JC  32.65 
 
 
189 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.03709e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0701  spore coat-associated protein JC  32.65 
 
 
189 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000246142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0766  cotJC protein  32.65 
 
 
189 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.13334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0714  cotJC protein  32.65 
 
 
189 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.98472e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0857  cotJC protein  32.65 
 
 
189 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2189  manganese containing catalase  32.14 
 
 
189 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1213  manganese containing catalase  35.16 
 
 
190 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.645424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0440  Catalase  32.14 
 
 
189 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0288  manganese containing catalase  28.03 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0934  spore coat peptide assembly protein CotJC  32.97 
 
 
188 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0072871  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3384  catalase  30.77 
 
 
231 aa  93.6  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000494245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  32.42 
 
 
188 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0414  manganese containing catalase  30.77 
 
 
203 aa  92.8  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>