More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0874 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  100 
 
 		 260 aa  527  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  56.69 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  53.82 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  53.33 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  52.94 
 
 		 256 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  52.94 
 
 		 256 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  53.78 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  52.38 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  49.03 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  47.33 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  48.81 
 
 		 256 aa  235  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  46.34 
 
 		 260 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  45.99 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  45.24 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  47.26 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  44.92 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  46.61 
 
 		 251 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  46.34 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  46.34 
 
 		 270 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  44.84 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  44.84 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2233  3-oxoadipate enol-lactonase  51.26 
 
 		 300 aa  211  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  44.4 
 
 		 263 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  45.38 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  45.78 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  42 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  43.2 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  42.69 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0162  3-oxoadipate enol-lactonase  44.22 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  44.12 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.22 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  44.49 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  43.03 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  44.17 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  42.63 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  42.63 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  42.63 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  42.63 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  38.46 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.63 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  42 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  42.63 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  46.81 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  42.23 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  46.61 
 
 		 393 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  43.88 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  43.93 
 
 		 263 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  41.83 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  42.63 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  41.83 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  41.83 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  41.83 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  40.87 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  41.83 
 
 		 261 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  44.72 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  42 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  43.95 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  39.27 
 
 		 373 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  43.87 
 
 		 393 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  41.6 
 
 		 263 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  47.68 
 
 		 393 aa  191  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  41.6 
 
 		 263 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  42.11 
 
 		 392 aa  191  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  43.08 
 
 		 263 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  40.59 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  43.55 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  44.35 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1118  3-oxoadipate enol-lactonase  45.45 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  38.06 
 
 		 396 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  41.7 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  36.99 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  43.1 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  40.65 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  42.74 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  43.78 
 
 		 258 aa  185  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  39.04 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  39.92 
 
 		 360 aa  182  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  39.11 
 
 		 377 aa  181  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  39.77 
 
 		 279 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  41.73 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3040  3-oxoadipate enol-lactonase  41.1 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  41.56 
 
 		 266 aa  178  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  40.66 
 
 		 263 aa  178  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  39.38 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  40.78 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  38.11 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  39.36 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  42.47 
 
 		 391 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  38.33 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  40.5 
 
 		 425 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  38.49 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  38.43 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  41.41 
 
 		 397 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  36.95 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  40.25 
 
 		 396 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  39.6 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  36.55 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  37.92 
 
 		 264 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  36.22 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>