More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0866 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  55.21 
 
 		 624 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  62.03 
 
 		 629 aa  783    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  100 
 
 		 656 aa  1341    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  67.85 
 
 		 623 aa  863    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  60.71 
 
 		 645 aa  720    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  60.23 
 
 		 616 aa  747    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  54.1 
 
 		 655 aa  634  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  55.15 
 
 		 629 aa  610  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  50.53 
 
 		 656 aa  607  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  50.45 
 
 		 667 aa  605  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  51.16 
 
 		 644 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  50.64 
 
 		 629 aa  598  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  51.11 
 
 		 628 aa  597  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  51.04 
 
 		 616 aa  594  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  50.63 
 
 		 634 aa  592  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  49.61 
 
 		 632 aa  587  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  49.38 
 
 		 651 aa  587  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  49.77 
 
 		 636 aa  578  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  52.31 
 
 		 628 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  48.58 
 
 		 657 aa  575  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  50 
 
 		 627 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  49.61 
 
 		 642 aa  575  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  47.63 
 
 		 641 aa  563  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  48.42 
 
 		 629 aa  561  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  48.33 
 
 		 658 aa  559  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  46.53 
 
 		 639 aa  537  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  46.21 
 
 		 639 aa  530  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  57.43 
 
 		 700 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  46.61 
 
 		 649 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  46.4 
 
 		 648 aa  511  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  44.26 
 
 		 652 aa  506  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  46.76 
 
 		 647 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  45.75 
 
 		 640 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  45.91 
 
 		 640 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  45.91 
 
 		 640 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  45.6 
 
 		 932 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  43.54 
 
 		 699 aa  451  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  39.77 
 
 		 718 aa  428  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  33.84 
 
 		 600 aa  306  8.000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  32.69 
 
 		 587 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  30.42 
 
 		 626 aa  295  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  32.63 
 
 		 583 aa  294  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  36.1 
 
 		 595 aa  289  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  32.31 
 
 		 582 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  39.25 
 
 		 587 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  33.5 
 
 		 588 aa  286  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  36.97 
 
 		 599 aa  283  9e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  39.16 
 
 		 588 aa  282  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  38.19 
 
 		 626 aa  279  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  36.88 
 
 		 587 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  33.59 
 
 		 601 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  32.96 
 
 		 584 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  38.94 
 
 		 592 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  38.95 
 
 		 587 aa  273  8.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  32.89 
 
 		 605 aa  273  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  38.26 
 
 		 618 aa  270  5e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  33.39 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  37.89 
 
 		 655 aa  266  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  33.47 
 
 		 632 aa  266  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  39.02 
 
 		 694 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  31.52 
 
 		 590 aa  264  3e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  32.2 
 
 		 604 aa  263  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.28 
 
 		 598 aa  263  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  34.89 
 
 		 598 aa  263  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.18 
 
 		 571 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.28 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.28 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.28 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.28 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.28 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  34.36 
 
 		 636 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  35.28 
 
 		 598 aa  261  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  35.28 
 
 		 598 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  37.5 
 
 		 642 aa  261  4e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  41.26 
 
 		 619 aa  261  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.12 
 
 		 600 aa  261  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  33.88 
 
 		 544 aa  260  4e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  31.37 
 
 		 590 aa  260  7e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  38.69 
 
 		 564 aa  259  8e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  32.57 
 
 		 588 aa  259  8e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  37.92 
 
 		 651 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  37.78 
 
 		 652 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.16 
 
 		 598 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  37.92 
 
 		 660 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  38.6 
 
 		 660 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  30.51 
 
 		 581 aa  258  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  38.6 
 
 		 660 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  32.21 
 
 		 611 aa  258  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  39.32 
 
 		 601 aa  257  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  30.68 
 
 		 581 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  30.68 
 
 		 581 aa  256  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  30.68 
 
 		 581 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  30.68 
 
 		 581 aa  256  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  30.68 
 
 		 581 aa  256  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  30.68 
 
 		 581 aa  256  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  38.37 
 
 		 660 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  36.72 
 
 		 614 aa  256  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  32 
 
 		 604 aa  256  9e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  37.12 
 
 		 605 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  31.18 
 
 		 588 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>