96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0854 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  520  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  65.75 
 
 
265 aa  328  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  65.35 
 
 
267 aa  318  7e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  57.54 
 
 
263 aa  275  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  54.3 
 
 
262 aa  264  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  53.17 
 
 
261 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  51.82 
 
 
302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  51.44 
 
 
258 aa  238  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  46.92 
 
 
300 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  48.97 
 
 
258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  52 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  48.98 
 
 
255 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  46.99 
 
 
289 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  47.76 
 
 
259 aa  204  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  47.98 
 
 
266 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  46.59 
 
 
287 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  48.75 
 
 
253 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  45.93 
 
 
255 aa  198  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  48.44 
 
 
319 aa  198  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  45.74 
 
 
326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  46.03 
 
 
257 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  46.12 
 
 
278 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  44.8 
 
 
273 aa  190  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  44.05 
 
 
281 aa  189  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  47.79 
 
 
297 aa  186  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  43.32 
 
 
301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  46.15 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  42.86 
 
 
258 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  41.85 
 
 
289 aa  176  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  41.2 
 
 
290 aa  175  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  42.21 
 
 
283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  46.34 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  43.2 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  40.62 
 
 
254 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  38.54 
 
 
333 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  40.87 
 
 
262 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  44.08 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  37.92 
 
 
307 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  41.37 
 
 
254 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  38.78 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  38.78 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.78 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  36.73 
 
 
256 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  30.77 
 
 
196 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  29.67 
 
 
196 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.35 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  28.02 
 
 
197 aa  89  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  28.57 
 
 
197 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  35.39 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  28.02 
 
 
197 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  28.02 
 
 
197 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  28.02 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  32.64 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  27.47 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  26.92 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  32.37 
 
 
234 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  29.14 
 
 
229 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  33.15 
 
 
234 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  33.03 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.65 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  33.01 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  31.58 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  30.77 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  32.6 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  32.26 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  37.78 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  34.84 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  29.17 
 
 
329 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  33.54 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  33.54 
 
 
240 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  30.65 
 
 
212 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  34.17 
 
 
379 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.41 
 
 
327 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  30.83 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1812  lipolytic protein G-D-S-L family  34.04 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000302668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  26.14 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  31.97 
 
 
343 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.93 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  28.96 
 
 
189 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  35.23 
 
 
265 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  28.99 
 
 
305 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.09 
 
 
329 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  29.95 
 
 
238 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  40 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  27.72 
 
 
324 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0761  lysophospholipase L1 related esterase  31.03 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  26.92 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  32.79 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  29.48 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  25 
 
 
204 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  29.79 
 
 
255 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  32.06 
 
 
201 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  32.93 
 
 
223 aa  43.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  24.76 
 
 
213 aa  42.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
322 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  28.32 
 
 
213 aa  42  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>