More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0845 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  100 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  83.78 
 
 		 162 aa  259  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  68.18 
 
 		 156 aa  209  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  67.33 
 
 		 173 aa  205  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  67.55 
 
 		 164 aa  204  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  64.52 
 
 		 160 aa  200  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  67.13 
 
 		 150 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  65.13 
 
 		 153 aa  196  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  65.56 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  63.95 
 
 		 149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  63.7 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  63.64 
 
 		 153 aa  189  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  63.01 
 
 		 151 aa  188  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  62.33 
 
 		 157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  60.14 
 
 		 177 aa  187  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  60.14 
 
 		 177 aa  187  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  60.14 
 
 		 177 aa  187  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  66.23 
 
 		 186 aa  186  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  67.12 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  60.13 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  59.12 
 
 		 187 aa  184  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  58.78 
 
 		 178 aa  183  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  58.78 
 
 		 184 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  61.33 
 
 		 201 aa  181  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  59.33 
 
 		 167 aa  179  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  60.67 
 
 		 159 aa  177  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  59.09 
 
 		 170 aa  177  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  56.58 
 
 		 183 aa  175  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  57.24 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  57.79 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  59.46 
 
 		 182 aa  170  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  53.75 
 
 		 188 aa  170  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  53.42 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  53.69 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  57.23 
 
 		 179 aa  157  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  55.24 
 
 		 182 aa  156  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  53.15 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12330  conserved hypothetical protein TIGR00043  55.56 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.37516  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  47.45 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  33.56 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  43.14 
 
 		 301 aa  97.1  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  32.89 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  32.89 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  44.92 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  38.85 
 
 		 157 aa  90.5  7e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  35.82 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.05 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.59 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  35.57 
 
 		 158 aa  87  9e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  39.16 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  41.04 
 
 		 446 aa  86.3  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  34.21 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  38.36 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  38.36 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  39.32 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  38.98 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  40 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  36.75 
 
 		 162 aa  84.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  41.28 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  35.62 
 
 		 161 aa  84  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  36.55 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  45.37 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  39.37 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  39.5 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  41.23 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2165  hypothetical protein  48.91 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  32.67 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  39.5 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  39.5 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  39.5 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  39.5 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  39.5 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  39.5 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  41.23 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  29.33 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  37.76 
 
 		 160 aa  80.1  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  40.35 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  37.24 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  35.17 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  40.35 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  36.05 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  40.54 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  34.27 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  33.97 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  30.23 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  33.56 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  34.25 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  36.5 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  32.28 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  35.77 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  35.77 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  35.77 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  32.28 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  35.77 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  35.66 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  38.53 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  40.54 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  41.88 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  38.18 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>