More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0787 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  61.63 
 
 
505 aa  647    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  64.67 
 
 
505 aa  642    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  64.29 
 
 
503 aa  639    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  66.07 
 
 
504 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  67.46 
 
 
507 aa  670    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  100 
 
 
500 aa  1017    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  73.24 
 
 
497 aa  754    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  66.13 
 
 
505 aa  645    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  63.24 
 
 
506 aa  642    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  66.73 
 
 
498 aa  660    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  76.66 
 
 
499 aa  781    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  69.7 
 
 
507 aa  696    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  62.03 
 
 
505 aa  647    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  64.33 
 
 
505 aa  655    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  69.11 
 
 
507 aa  693    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  63.71 
 
 
498 aa  633  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  65.07 
 
 
504 aa  634  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  64.92 
 
 
502 aa  629  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  60.04 
 
 
514 aa  626  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  62.17 
 
 
499 aa  623  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  63.04 
 
 
510 aa  622  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  63.13 
 
 
501 aa  621  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  63.16 
 
 
522 aa  611  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  61.4 
 
 
504 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  61.17 
 
 
504 aa  611  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  60.36 
 
 
499 aa  605  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  58.85 
 
 
505 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  61.37 
 
 
500 aa  605  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  61 
 
 
504 aa  608  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  61.37 
 
 
499 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  60.28 
 
 
504 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  59.08 
 
 
503 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  62.3 
 
 
499 aa  597  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  62.1 
 
 
496 aa  598  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  60.16 
 
 
507 aa  591  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  61.74 
 
 
501 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  61.54 
 
 
501 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  61.34 
 
 
501 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5040  glycerol kinase  61.2 
 
 
502 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  60.04 
 
 
517 aa  579  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  58.2 
 
 
505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  59.24 
 
 
509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  58.75 
 
 
499 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  59.96 
 
 
514 aa  570  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  58.25 
 
 
510 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  58.25 
 
 
510 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  58.8 
 
 
505 aa  565  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  58.25 
 
 
510 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  55.47 
 
 
505 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  59.96 
 
 
505 aa  551  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  59.24 
 
 
506 aa  549  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  60.2 
 
 
505 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  57.49 
 
 
510 aa  545  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  52.69 
 
 
505 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  53.31 
 
 
499 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5304  glycerol kinase  57.26 
 
 
507 aa  542  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  51.9 
 
 
500 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  51.41 
 
 
498 aa  539  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  52.5 
 
 
500 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  54.69 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  52.1 
 
 
500 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  52.74 
 
 
496 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  53.31 
 
 
499 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  57.4 
 
 
505 aa  535  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  57.4 
 
 
505 aa  535  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  52.71 
 
 
499 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  52.1 
 
 
500 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  52.1 
 
 
500 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  52.33 
 
 
496 aa  535  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  52.1 
 
 
500 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  58 
 
 
505 aa  537  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  51.84 
 
 
513 aa  532  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  51.9 
 
 
503 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  51.9 
 
 
503 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  52.1 
 
 
500 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  51.9 
 
 
518 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  51.9 
 
 
518 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  51.9 
 
 
518 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  51.9 
 
 
518 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  51.9 
 
 
518 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1122  glycerol kinase  51.57 
 
 
513 aa  528  1e-149  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  51.69 
 
 
513 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  50.81 
 
 
499 aa  528  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  57 
 
 
505 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  50.61 
 
 
498 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  51.37 
 
 
510 aa  526  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  50.61 
 
 
498 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  57.2 
 
 
505 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  52.77 
 
 
505 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  52.43 
 
 
494 aa  521  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0934  glycerol kinase  51.57 
 
 
527 aa  519  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  54.73 
 
 
496 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  53.72 
 
 
501 aa  518  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  52.6 
 
 
505 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  52.63 
 
 
494 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  52.63 
 
 
494 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  52.06 
 
 
509 aa  519  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1472  glycerol kinase  51.95 
 
 
510 aa  520  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  51.78 
 
 
505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  49.9 
 
 
507 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>