162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0724 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  100 
 
 		 1321 aa  2697    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  42.99 
 
 		 1336 aa  974    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  45.49 
 
 		 1322 aa  1058    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  38.03 
 
 		 1306 aa  795    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  51.66 
 
 		 1358 aa  1251    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  37.48 
 
 		 1319 aa  702    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  50.23 
 
 		 1219 aa  999    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  43.74 
 
 		 1318 aa  977    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  39.18 
 
 		 1354 aa  863    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  47.4 
 
 		 1055 aa  845    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  35.32 
 
 		 1459 aa  689    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  42.99 
 
 		 1331 aa  946    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  39.91 
 
 		 1712 aa  716    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  36.5 
 
 		 1373 aa  734    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  36.5 
 
 		 1422 aa  743    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  53.97 
 
 		 1338 aa  1399    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  34.49 
 
 		 1343 aa  703    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  35.64 
 
 		 1339 aa  738    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  35.63 
 
 		 1333 aa  751    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  36.98 
 
 		 1322 aa  700    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  34.63 
 
 		 1338 aa  697    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  41.21 
 
 		 1355 aa  975    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  29.97 
 
 		 1442 aa  443  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  32.59 
 
 		 1282 aa  389  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  32.47 
 
 		 1290 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1243 aa  323  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1581 aa  213  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  22.56 
 
 		 1277 aa  211  8e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  21.1 
 
 		 1250 aa  210  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1250 aa  209  3e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  34.73 
 
 		 926 aa  207  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.29 
 
 		 1432 aa  197  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  22.39 
 
 		 1278 aa  195  4e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1332 aa  167  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1022 aa  157  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1375 aa  157  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1349 aa  145  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1098 aa  140  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1612 aa  134  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1426 aa  132  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1461 aa  132  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1298 aa  128  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1452 aa  127  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1321 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1353 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1709 aa  119  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1441 aa  119  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  20.31 
 
 		 826 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  37.65 
 
 		 846 aa  113  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1347 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1363 aa  110  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1342 aa  109  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1339 aa  105  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1339 aa  105  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1409 aa  105  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  41.45 
 
 		 1365 aa  103  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  39.02 
 
 		 1440 aa  103  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1346 aa  102  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  26.84 
 
 		 1581 aa  102  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  37.82 
 
 		 1347 aa  101  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  37.82 
 
 		 1572 aa  101  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  34.54 
 
 		 1557 aa  97.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  36.18 
 
 		 1366 aa  96.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1575 aa  94.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.05 
 
 		 1573 aa  92.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1579 aa  92  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1642 aa  90.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1640 aa  90.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1644 aa  90.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1546 aa  88.6  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  34.42 
 
 		 1640 aa  88.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  33.75 
 
 		 1751 aa  85.9  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  40.38 
 
 		 1041 aa  81.6  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  19.47 
 
 		 1186 aa  80.9  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  27.66 
 
 		 974 aa  74.3  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  29.7 
 
 		 1058 aa  71.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1104 aa  71.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  20.51 
 
 		 1089 aa  71.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  28.83 
 
 		 1002 aa  70.5  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  38.68 
 
 		 1147 aa  69.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1195 aa  69.3  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  28.02 
 
 		 995 aa  68.9  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  22.22 
 
 		 1257 aa  68.2  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  22.55 
 
 		 1244 aa  67  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  28.81 
 
 		 1189 aa  65.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  22.07 
 
 		 1252 aa  65.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  22.41 
 
 		 1159 aa  65.1  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  27.22 
 
 		 1020 aa  62.4  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1210 aa  62.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1282 aa  61.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  28.22 
 
 		 1038 aa  60.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1209 aa  60.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1036 aa  60.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  27.6 
 
 		 746 aa  60.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1178 aa  60.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1177 aa  60.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1209 aa  60.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1120 aa  59.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1359 aa  59.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1233 aa  58.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>