265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0696 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  100 
 
 
328 aa  644    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  59.68 
 
 
313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  50.32 
 
 
325 aa  285  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  51.58 
 
 
315 aa  270  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  44.74 
 
 
333 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  51.58 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  51.16 
 
 
308 aa  241  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  44.23 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  43.48 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  46.25 
 
 
328 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  43.45 
 
 
316 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  47.17 
 
 
321 aa  202  9e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  45.07 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  43.69 
 
 
325 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  43.67 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  42.77 
 
 
325 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  42.77 
 
 
325 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  42.77 
 
 
325 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  46.86 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  42.95 
 
 
344 aa  162  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  42.27 
 
 
332 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  32.33 
 
 
306 aa  159  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  34 
 
 
319 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  30.67 
 
 
309 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  35.16 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  40 
 
 
330 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  34.44 
 
 
310 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 
303 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  34.04 
 
 
303 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  32.19 
 
 
306 aa  149  8e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  33.69 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  33.69 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  33.69 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  33.69 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  33.69 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  33.69 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  33.69 
 
 
303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  32.44 
 
 
310 aa  146  6e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  36.86 
 
 
318 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 
303 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
312 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  34.63 
 
 
312 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  35.37 
 
 
311 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  35.03 
 
 
311 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  30.77 
 
 
311 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  32.86 
 
 
303 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  35.28 
 
 
324 aa  143  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  32.11 
 
 
310 aa  142  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  36.86 
 
 
316 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  28.52 
 
 
305 aa  142  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1791  ribokinase-like domain-containing protein  35.28 
 
 
326 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.176748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22310  1-phosphofructokinase  38.01 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  34.11 
 
 
322 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  35.14 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  35.14 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  35.14 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  34.8 
 
 
309 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  34.09 
 
 
318 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  34.8 
 
 
309 aa  136  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  32.78 
 
 
311 aa  136  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  35.76 
 
 
310 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  34.8 
 
 
309 aa  135  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  35.14 
 
 
309 aa  135  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  34.8 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  34.8 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  31.58 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32.57 
 
 
316 aa  133  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  32.51 
 
 
310 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 
315 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  34.46 
 
 
310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  28.24 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2359  1-phosphofructokinase  42.45 
 
 
301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  34.46 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  34.12 
 
 
310 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  34.12 
 
 
310 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  32.57 
 
 
304 aa  130  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  34.12 
 
 
310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  33.46 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  33.22 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  31.71 
 
 
307 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  28.28 
 
 
302 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  29.12 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 
312 aa  127  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  34.06 
 
 
332 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  27.76 
 
 
308 aa  126  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  34.55 
 
 
312 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6479  6-phosphofructokinase  35.67 
 
 
312 aa  125  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  31.36 
 
 
307 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  35.67 
 
 
350 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  29.12 
 
 
306 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  35.76 
 
 
315 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  36.36 
 
 
315 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  29.55 
 
 
310 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  34.04 
 
 
312 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  35.62 
 
 
315 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  32.89 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  34.71 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  34.19 
 
 
334 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  29.89 
 
 
330 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>