More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0683 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 		 365 aa  737    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3677  radical SAM enzyme, Cfr family  85.95 
 
 		 365 aa  636    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  81.49 
 
 		 388 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1869  radical SAM protein  75.69 
 
 		 374 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1000  radical SAM enzyme, Cfr family  79.5 
 
 		 388 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189733  normal  0.570497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  74.31 
 
 		 395 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1678  radical SAM enzyme, Cfr family  70.64 
 
 		 371 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5902  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  72.18 
 
 		 368 aa  518  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09960  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  72.01 
 
 		 370 aa  511  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.434962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1420  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  69.13 
 
 		 391 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0340942  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  73.93 
 
 		 353 aa  508  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  72.38 
 
 		 380 aa  511  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2114  radical SAM enzyme, Cfr family  70.08 
 
 		 368 aa  504  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  72.02 
 
 		 388 aa  502  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3237  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  68.58 
 
 		 376 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2178  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  71.07 
 
 		 372 aa  497  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0846545  hitchhiker  0.000495188 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11240  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  61.67 
 
 		 426 aa  485  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.43214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2223  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  67.49 
 
 		 365 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23560  radical SAM enzyme, Cfr family  67.7 
 
 		 364 aa  484  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4121  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  67.21 
 
 		 365 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1489  radical SAM enzyme, Cfr family  66.95 
 
 		 375 aa  477  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1009  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  63.99 
 
 		 376 aa  476  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.834278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2502  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  67.13 
 
 		 383 aa  475  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293735  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12894  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  67.03 
 
 		 364 aa  471  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.942196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  66.4 
 
 		 430 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3980  radical SAM enzyme, Cfr family  68.8 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1987  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  67.92 
 
 		 374 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0876088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2006  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  67.92 
 
 		 374 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578114  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21300  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  61.89 
 
 		 465 aa  458  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.830404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2052  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  67.92 
 
 		 374 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3577  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  66.48 
 
 		 421 aa  444  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10170  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  61.64 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1166  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  67.88 
 
 		 385 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800858  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0409  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60 
 
 		 389 aa  425  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.112692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1185  radical SAM enzyme, Cfr family  60.72 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.14 
 
 		 363 aa  319  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.01 
 
 		 361 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  47.99 
 
 		 354 aa  290  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3583  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.99 
 
 		 399 aa  279  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1376  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.52 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0164  radical SAM enzyme, Cfr family  49.68 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  42.54 
 
 		 371 aa  266  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  43.97 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  45.64 
 
 		 372 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  45.35 
 
 		 372 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  39.71 
 
 		 348 aa  256  6e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  45.35 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  42.72 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.6 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  46.47 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  42.51 
 
 		 349 aa  252  6e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.14 
 
 		 365 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.3 
 
 		 349 aa  249  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  42.06 
 
 		 344 aa  248  9e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.66 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.21 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  39.77 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  40.35 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.66 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  41.19 
 
 		 350 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.92 
 
 		 347 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  42.9 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  41.31 
 
 		 351 aa  246  4e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  45.43 
 
 		 359 aa  246  6e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  45.38 
 
 		 377 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  43.52 
 
 		 366 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.64 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  43.41 
 
 		 362 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.68 
 
 		 344 aa  245  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4255  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.54 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  39.94 
 
 		 351 aa  243  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  44.26 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  43.47 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.06 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.36 
 
 		 355 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  40 
 
 		 382 aa  242  7e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  43.02 
 
 		 348 aa  242  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1388  radical SAM enzyme, Cfr family  43.03 
 
 		 462 aa  242  7e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  41.74 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.21 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  43.23 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  42.9 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2543  radical SAM enzyme, Cfr family  41.32 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180565  hitchhiker  0.00648935 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  40 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  42.06 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.9 
 
 		 343 aa  241  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5115  hypothetical protein  42.25 
 
 		 379 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1592  hypothetical protein  41.32 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_3052  predicted protein  43.14 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1838  radical SAM protein  41.74 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  43.02 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6265  hypothetical protein  41.74 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.86 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1814  radical SAM protein  41.74 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  41.38 
 
 		 357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1999  hypothetical protein  44.81 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1725  radical SAM protein  41.74 
 
 		 379 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.15 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.15 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.15 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>