More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0570 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  100 
 
 
1129 aa  2254    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  62.65 
 
 
1117 aa  828    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  52.97 
 
 
719 aa  610  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  52.38 
 
 
1306 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  48.94 
 
 
724 aa  567  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.11 
 
 
747 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  42.83 
 
 
822 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  41.91 
 
 
961 aa  459  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  44.15 
 
 
695 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  40.06 
 
 
867 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  41.98 
 
 
764 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.38 
 
 
764 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
778 aa  396  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  39.43 
 
 
836 aa  385  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  37.88 
 
 
978 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.97 
 
 
890 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  38.12 
 
 
859 aa  349  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  36.39 
 
 
1245 aa  348  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  35.54 
 
 
808 aa  342  2.9999999999999998e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  36.63 
 
 
752 aa  341  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  36.64 
 
 
774 aa  336  1e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  37.58 
 
 
803 aa  335  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.32 
 
 
814 aa  331  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 
1065 aa  327  7e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
806 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
806 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
806 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  37 
 
 
725 aa  325  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  34.13 
 
 
727 aa  317  8e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  35.78 
 
 
838 aa  311  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  34.65 
 
 
825 aa  310  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  34.5 
 
 
761 aa  308  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  33.29 
 
 
784 aa  305  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 
950 aa  296  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  33.99 
 
 
643 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  33.99 
 
 
643 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  34.57 
 
 
618 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
975 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
815 aa  284  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  34.05 
 
 
821 aa  284  7.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  34.05 
 
 
643 aa  282  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
979 aa  280  8e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  33.28 
 
 
830 aa  278  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  32.41 
 
 
625 aa  271  5e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.05 
 
 
761 aa  271  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  33.75 
 
 
668 aa  267  7e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  32.62 
 
 
837 aa  266  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  33.74 
 
 
734 aa  266  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  32.72 
 
 
765 aa  266  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  35.8 
 
 
693 aa  266  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  32.87 
 
 
839 aa  266  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  34.04 
 
 
704 aa  265  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  32.87 
 
 
830 aa  263  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  32.16 
 
 
837 aa  263  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  32.21 
 
 
640 aa  262  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  31.7 
 
 
833 aa  261  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  32.43 
 
 
640 aa  261  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  32.11 
 
 
905 aa  261  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  31.62 
 
 
710 aa  261  7e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  34.78 
 
 
732 aa  260  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  34.02 
 
 
704 aa  260  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  32.85 
 
 
648 aa  260  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  33.22 
 
 
662 aa  259  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  32.11 
 
 
679 aa  258  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  32.31 
 
 
676 aa  259  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  32.67 
 
 
834 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  33.86 
 
 
726 aa  258  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  32.51 
 
 
835 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  32.47 
 
 
832 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  32.96 
 
 
734 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  31.75 
 
 
824 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.27 
 
 
661 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  31.84 
 
 
723 aa  256  2.0000000000000002e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  31.47 
 
 
735 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  32.59 
 
 
892 aa  255  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  31.75 
 
 
824 aa  255  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  32.32 
 
 
714 aa  255  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 
654 aa  255  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.05 
 
 
769 aa  254  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  32.69 
 
 
828 aa  254  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  31.96 
 
 
807 aa  254  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  32.22 
 
 
776 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  32.98 
 
 
739 aa  252  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  32.29 
 
 
680 aa  252  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  33.75 
 
 
667 aa  252  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  32.36 
 
 
834 aa  252  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  32.15 
 
 
789 aa  252  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
819 aa  251  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  31.66 
 
 
680 aa  251  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  33.62 
 
 
658 aa  250  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  32.2 
 
 
846 aa  250  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  32.16 
 
 
820 aa  249  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  31.66 
 
 
667 aa  249  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  31.89 
 
 
714 aa  249  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  31.35 
 
 
680 aa  249  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  32.25 
 
 
718 aa  248  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  32.25 
 
 
724 aa  248  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  33.06 
 
 
836 aa  248  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0345  glycosyl transferase family 51  31.27 
 
 
987 aa  248  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0145524 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  29.95 
 
 
708 aa  248  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>