28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0569 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0569  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  431  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  69.05 
 
 
212 aa  292  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3661  hypothetical protein  66.83 
 
 
231 aa  276  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8251  hypothetical protein  62.25 
 
 
210 aa  265  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2876  hypothetical protein  63.24 
 
 
210 aa  265  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5715  hypothetical protein  61.95 
 
 
227 aa  262  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5475  hypothetical protein  61.95 
 
 
223 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1102  hypothetical protein  63.82 
 
 
224 aa  260  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5096  hypothetical protein  61.46 
 
 
223 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0823672  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5184  hypothetical protein  61.46 
 
 
223 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2147  hypothetical protein  64.53 
 
 
205 aa  258  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2796  hypothetical protein  59.9 
 
 
222 aa  248  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551909  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3869  hypothetical protein  60.29 
 
 
233 aa  246  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  58.73 
 
 
190 aa  221  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2009  hypothetical protein  57.44 
 
 
200 aa  221  6e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.567228  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  55.9 
 
 
204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3597  hypothetical protein  57.3 
 
 
235 aa  213  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0009  hypothetical protein  58 
 
 
205 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  46.23 
 
 
209 aa  185  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  45.59 
 
 
204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0492  hypothetical protein  38.38 
 
 
267 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0328  hypothetical protein  32.82 
 
 
235 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2745  hypothetical protein  26.32 
 
 
378 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0347  hypothetical protein  29.41 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.834243 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0368  hypothetical protein  29.41 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.810453  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0358  hypothetical protein  29.41 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3565  hypothetical protein  37.04 
 
 
219 aa  42  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.876515  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1779  hypothetical protein  37.04 
 
 
219 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>