More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0447 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 167 aa  337  4e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  81.21 
 
 		 166 aa  276  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  77.58 
 
 		 166 aa  270  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  75.15 
 
 		 166 aa  266  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  71.52 
 
 		 167 aa  248  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  64.24 
 
 		 164 aa  209  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  61.82 
 
 		 162 aa  202  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  64.15 
 
 		 160 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  60.9 
 
 		 160 aa  198  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  60.24 
 
 		 164 aa  195  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  59.76 
 
 		 164 aa  189  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  58.68 
 
 		 164 aa  186  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  60.65 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  62.05 
 
 		 161 aa  185  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  56.89 
 
 		 167 aa  184  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  60.13 
 
 		 163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  55.15 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  60.24 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  59.63 
 
 		 160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  59.01 
 
 		 160 aa  176  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  57.49 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  57.23 
 
 		 162 aa  170  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  56.6 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  53.37 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  53.09 
 
 		 164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  53.09 
 
 		 164 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  53.09 
 
 		 164 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  55.35 
 
 		 163 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  53.09 
 
 		 164 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  51.53 
 
 		 164 aa  158  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  50.62 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  49.37 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  50 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  46.54 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  41.43 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  41.73 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  39.31 
 
 		 161 aa  94.4  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  38.85 
 
 		 160 aa  94.4  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  42.25 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  40.29 
 
 		 156 aa  94  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  42.25 
 
 		 157 aa  93.2  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  39.01 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  40.43 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  39.01 
 
 		 158 aa  91.3  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 158 aa  91.3  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  40.29 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  42.45 
 
 		 154 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  39.44 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  36.36 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  36.36 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  36.36 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  39.31 
 
 		 155 aa  89  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 160 aa  87.8  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 157 aa  87.8  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  36.84 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  35.8 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 158 aa  85.9  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  37.09 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  39.29 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  38.51 
 
 		 158 aa  84.3  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  40.71 
 
 		 158 aa  84.3  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  36.84 
 
 		 160 aa  84  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  36.55 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  34.39 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  37.24 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  37.34 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  38.51 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  37.84 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  38.51 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  38.57 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  38.57 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  37.59 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  40 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  35.81 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>