More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0354 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  100 
 
 
285 aa  557  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  72.73 
 
 
283 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  56.77 
 
 
335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3051  Rhodanese domain protein  54.98 
 
 
272 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0410601  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  55.69 
 
 
310 aa  257  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  48.74 
 
 
288 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  47.64 
 
 
291 aa  221  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  47 
 
 
285 aa  204  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  50.38 
 
 
275 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  47.89 
 
 
284 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.55 
 
 
284 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  46.07 
 
 
283 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  41.73 
 
 
278 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  46.74 
 
 
285 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.55 
 
 
284 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.73 
 
 
282 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.12 
 
 
278 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  48.73 
 
 
627 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  45.42 
 
 
289 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.61 
 
 
276 aa  191  9e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.87 
 
 
299 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  45.55 
 
 
278 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  52.06 
 
 
282 aa  190  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  47.39 
 
 
375 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.27 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  41.31 
 
 
276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  47.64 
 
 
687 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  44.64 
 
 
281 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  43.62 
 
 
290 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  46.48 
 
 
291 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  44.71 
 
 
312 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.86 
 
 
280 aa  186  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  48.64 
 
 
270 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  47.86 
 
 
280 aa  185  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  37.45 
 
 
276 aa  185  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.15 
 
 
287 aa  185  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  41.94 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.69 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  38.2 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.86 
 
 
284 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  44.04 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.32 
 
 
289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2370  Rhodanese domain protein  51.12 
 
 
298 aa  181  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000188451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  37.83 
 
 
277 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 
285 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  38.58 
 
 
277 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  45.71 
 
 
272 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  41.61 
 
 
284 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0677  Rhodanese domain protein  49.62 
 
 
299 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  39.47 
 
 
272 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  43.93 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  41.22 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  37.45 
 
 
277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2623  rhodanese domain-containing protein  37.64 
 
 
283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  43.43 
 
 
284 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  46.72 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  38.43 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  38.43 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  38.43 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  40.86 
 
 
284 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  38.43 
 
 
277 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  37.83 
 
 
277 aa  178  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  38.43 
 
 
277 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  47.26 
 
 
282 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  46.74 
 
 
276 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  39.45 
 
 
278 aa  175  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.25 
 
 
292 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  38.75 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  45.49 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  41.85 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  45.19 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  41.48 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  38.24 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  38.24 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  44.37 
 
 
288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  42.65 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  42.65 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.65 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  42.09 
 
 
284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  42.65 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  42.65 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  42.65 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.65 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  38.35 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  42.28 
 
 
289 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29210  rhodanese-related sulfurtransferase  45.19 
 
 
297 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  44.2 
 
 
289 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.2 
 
 
289 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 
289 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.2 
 
 
289 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.06 
 
 
292 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  40.44 
 
 
285 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1994  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.44 
 
 
286 aa  169  7e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  45.91 
 
 
288 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  38.91 
 
 
296 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.32 
 
 
289 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.54 
 
 
284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.39 
 
 
290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1095  Rhodanese domain protein  34.85 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  44.44 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>