120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0333 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  100 
 
 		 162 aa  326  9e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  51.43 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  37.17 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  35.34 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.4 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  40.4 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  35.45 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  33.03 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  36.96 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  32.38 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  30 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  23.85 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 132 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  32.74 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  30.7 
 
 		 111 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 117 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 111 aa  51.6  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 110 aa  50.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  28 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  34.88 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  26.13 
 
 		 111 aa  50.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  36.26 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  26.55 
 
 		 116 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  27.88 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  25.27 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  28.81 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  25.45 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  26.47 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  28 
 
 		 116 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  24.55 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 120 aa  47.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  26.55 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  22.22 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  26.55 
 
 		 116 aa  45.8  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  27.68 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11396  anti-anti-sigma factor rsfA  30.09 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.971346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  39.22 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  24.53 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  26.79 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1364  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.63 
 
 		 117 aa  44.7  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.941434 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.36 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  39.06 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 115 aa  44.7  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 		 127 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 104 aa  44.3  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 116 aa  44.3  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  27.88 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  38.89 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12656  hypothetical protein  30.6 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000514041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 109 aa  43.9  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 114 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  26.13 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  21.57 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  23.89 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 108 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 118 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  27.45 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0085  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 117 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  32.14 
 
 		 124 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  22.12 
 
 		 109 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  23.4 
 
 		 111 aa  42  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 116 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 116 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  24.53 
 
 		 112 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1048  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  37.08 
 
 		 137 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0475989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  27.52 
 
 		 118 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0046  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.85 
 
 		 113 aa  41.6  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2189  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 111 aa  41.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>