More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0329 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 435 aa  833    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.85 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  52.31 
 
 		 442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.97 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.93 
 
 		 586 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  49.34 
 
 		 452 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  53.12 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.86 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  46.15 
 
 		 416 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  49.34 
 
 		 463 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  54.55 
 
 		 439 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  50 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  44.4 
 
 		 429 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.68 
 
 		 403 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  42.8 
 
 		 383 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  45.79 
 
 		 433 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 		 428 aa  176  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.56 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  44.53 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.33 
 
 		 395 aa  170  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.22 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  39.08 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  41.6 
 
 		 420 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  50.7 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 		 445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  35.73 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 		 624 aa  163  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.23 
 
 		 417 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.92 
 
 		 375 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  41.15 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  47.64 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.06 
 
 		 415 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  43.95 
 
 		 442 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  49.07 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 445 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 		 438 aa  156  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  42.66 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.15 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  38.98 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.21 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  39.32 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  43.64 
 
 		 434 aa  151  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.87 
 
 		 621 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.25 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  42.92 
 
 		 476 aa  147  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  48.18 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.42 
 
 		 725 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.62 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  40.16 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 388 aa  143  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.57 
 
 		 508 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 343 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  39.84 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 		 411 aa  136  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 		 465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  40.38 
 
 		 419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  46.57 
 
 		 587 aa  134  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  35.12 
 
 		 410 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 		 570 aa  129  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 326 aa  129  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 		 594 aa  126  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  40.09 
 
 		 237 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  39.05 
 
 		 580 aa  124  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 417 aa  122  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  43.04 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  36.08 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  35.56 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  38.3 
 
 		 389 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 595 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 470 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  37.12 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 775 aa  107  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  37.74 
 
 		 489 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  37.55 
 
 		 687 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 564 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 565 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  35.4 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 576 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 		 537 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 725 aa  100  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  30.56 
 
 		 287 aa  99.8  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  35.24 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 490 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 403 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2444  histidine kinase  37.7 
 
 		 425 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000824837  normal  0.0922124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>