109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0321 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  74.34 
 
 		 152 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  74.48 
 
 		 153 aa  224  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  70.34 
 
 		 150 aa  217  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  73.1 
 
 		 151 aa  217  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  65.22 
 
 		 151 aa  193  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  60.67 
 
 		 150 aa  184  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  55.86 
 
 		 151 aa  169  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  55.17 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  54.48 
 
 		 150 aa  163  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  56.55 
 
 		 150 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  56.55 
 
 		 150 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  54.48 
 
 		 150 aa  160  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  58.22 
 
 		 146 aa  150  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  51.41 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  52.53 
 
 		 165 aa  147  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  51.41 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  47.59 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  47.59 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  50 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  42.76 
 
 		 153 aa  123  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  61.84 
 
 		 120 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  38.73 
 
 		 154 aa  107  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  60.81 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  37.41 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  63.24 
 
 		 86 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  41.6 
 
 		 163 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  64.06 
 
 		 71 aa  91.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  38.78 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.6 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.6 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.25 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.6 
 
 		 163 aa  84.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.36 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.59 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.06 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.06 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  35.77 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  38.05 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  30.95 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.98 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2092  hypothetical protein  54.55 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0956237 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  37.66 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.44 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  32.63 
 
 		 198 aa  50.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  31.58 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  31.58 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  31.58 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  31.58 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  31.58 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  32.63 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  32.63 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  32.63 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  32.63 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  32.63 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  32.63 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  32.63 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  32.63 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  32.88 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.52 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  36 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  29.17 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  29.17 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  29.17 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  29.17 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  36.08 
 
 		 204 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.82 
 
 		 204 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  32.29 
 
 		 200 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  30.21 
 
 		 200 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  28.12 
 
 		 200 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  28.12 
 
 		 200 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  29.17 
 
 		 200 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  29.17 
 
 		 200 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  29.11 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  31.25 
 
 		 199 aa  44.3  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  28.12 
 
 		 199 aa  43.9  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2319  hypothetical protein  82.61 
 
 		 343 aa  43.9  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 200 aa  43.9  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.57 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  31.91 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  29.17 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  30.21 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5986  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):flavodoxin/nitric oxide synthase  28.12 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  28.12 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  30.93 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0643  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  38.36 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  30.93 
 
 		 203 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  35.06 
 
 		 188 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  31.18 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  27.08 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  27.08 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  27.08 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  34.41 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  30.21 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  29.79 
 
 		 207 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  32.29 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  32.26 
 
 		 199 aa  41.6  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  29.47 
 
 		 199 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>