More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0291 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  100 
 
 
324 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  64.1 
 
 
330 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  54.46 
 
 
314 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  51.92 
 
 
353 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  48.87 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  49.17 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  46.5 
 
 
319 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.39 
 
 
310 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  47.33 
 
 
321 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.59 
 
 
347 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  42.16 
 
 
309 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.87 
 
 
304 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  38.46 
 
 
304 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  49.54 
 
 
285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  44.95 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  43.07 
 
 
302 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  50 
 
 
276 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  40.39 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  39.14 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  36.13 
 
 
310 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  39.74 
 
 
315 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  39.62 
 
 
309 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  38.44 
 
 
312 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  39.48 
 
 
322 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  49.52 
 
 
301 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4839  ABC transporter related protein  45.34 
 
 
314 aa  192  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  45.81 
 
 
300 aa  192  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  48.13 
 
 
290 aa  192  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  39.48 
 
 
319 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  37.38 
 
 
308 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  41.05 
 
 
343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  49.28 
 
 
284 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  49.51 
 
 
282 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  40.65 
 
 
303 aa  189  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  35.1 
 
 
308 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  37.17 
 
 
310 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  39.3 
 
 
331 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  38.28 
 
 
301 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  37.79 
 
 
309 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2770  ABC transporter related  38.51 
 
 
319 aa  186  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  40.34 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 
280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  36.48 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  43.63 
 
 
254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  48.29 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  47.64 
 
 
301 aa  183  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  39.27 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.06 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  38.24 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  42.2 
 
 
301 aa  182  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
308 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  39.03 
 
 
330 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.81 
 
 
331 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0582  ABC transporter related protein  46.26 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.03 
 
 
313 aa  179  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  38.54 
 
 
300 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  42.25 
 
 
314 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
302 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
300 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  46.08 
 
 
319 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  49.74 
 
 
297 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 
313 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  35.74 
 
 
327 aa  176  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  37.24 
 
 
388 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  43.72 
 
 
263 aa  176  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  37.2 
 
 
303 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  40.42 
 
 
300 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  40.71 
 
 
295 aa  175  7e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  45.41 
 
 
284 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  40.42 
 
 
300 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  42.86 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  37.34 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  41.4 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  37.34 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  37.34 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  40.42 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  35.31 
 
 
324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  37.21 
 
 
303 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  37.06 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  47.44 
 
 
281 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  36.1 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  36.18 
 
 
338 aa  172  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  50.26 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  39.37 
 
 
246 aa  172  9e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  38.19 
 
 
299 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  36.36 
 
 
339 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 
300 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  36.36 
 
 
339 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  45.58 
 
 
317 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  37.93 
 
 
339 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.23 
 
 
338 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.34 
 
 
320 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  41.18 
 
 
256 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.75 
 
 
345 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 
305 aa  170  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  47.22 
 
 
289 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  35.95 
 
 
322 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>