More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0288 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  100 
 
 		 201 aa  394  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  72.64 
 
 		 223 aa  290  9e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  65.67 
 
 		 197 aa  251  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  65.67 
 
 		 197 aa  247  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.19 
 
 		 208 aa  235  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.2 
 
 		 201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.7 
 
 		 201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  57 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.5 
 
 		 204 aa  228  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  61.69 
 
 		 201 aa  227  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 201 aa  226  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  60.2 
 
 		 201 aa  225  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.71 
 
 		 201 aa  221  7e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 203 aa  220  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  63.5 
 
 		 205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.2 
 
 		 201 aa  214  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.71 
 
 		 201 aa  214  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.04 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  55.45 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  56 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  53.5 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.22 
 
 		 200 aa  207  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 201 aa  204  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.22 
 
 		 201 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 205 aa  201  7e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  52.48 
 
 		 204 aa  198  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 200 aa  194  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 200 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  51.24 
 
 		 227 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  51.23 
 
 		 203 aa  192  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.34 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  52.24 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  188  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  188  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  56.93 
 
 		 200 aa  188  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  188  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.73 
 
 		 200 aa  187  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.24 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.74 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.76 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.16 
 
 		 190 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.74 
 
 		 201 aa  181  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.25 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.25 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.24 
 
 		 201 aa  178  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.76 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.5 
 
 		 208 aa  171  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 198 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 202 aa  171  9e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.26 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.5 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  51.24 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  44.72 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  46.83 
 
 		 202 aa  157  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.03 
 
 		 198 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 198 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 198 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7316  response regulator receiver protein  45.77 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  46.04 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  44.29 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2610  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.31 
 
 		 144 aa  149  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000438854  normal  0.0112001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 222 aa  141  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1383  two component LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000320378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1410  response regulator receiver  33.83 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000440417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  33.83 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  36.5 
 
 		 200 aa  138  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.61 
 
 		 213 aa  137  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3614  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.27 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.765091  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  38.65 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 208 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.54 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.26 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.83 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  34.91 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 216 aa  128  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 226 aa  127  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.44 
 
 		 232 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>