More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0286 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.14 
 
 		 1954 aa  1373    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  53.03 
 
 		 1695 aa  1264    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  56.94 
 
 		 1390 aa  678    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.58 
 
 		 1159 aa  1189    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.75 
 
 		 2010 aa  1310    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  50.58 
 
 		 1896 aa  1299    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.82 
 
 		 1214 aa  1368    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.19 
 
 		 1843 aa  1362    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.65 
 
 		 1782 aa  1352    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.6 
 
 		 1964 aa  1341    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  58.85 
 
 		 1400 aa  1237    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1406 aa  2839    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.19 
 
 		 1119 aa  1273    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.65 
 
 		 1917 aa  1379    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.74 
 
 		 1482 aa  1321    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  50.26 
 
 		 2037 aa  1273    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.31 
 
 		 2107 aa  1325    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.57 
 
 		 1942 aa  1349    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  73.95 
 
 		 1478 aa  2051    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.11 
 
 		 1853 aa  1367    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.69 
 
 		 1406 aa  1248    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.24 
 
 		 2099 aa  1278    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  63.54 
 
 		 1392 aa  1715    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  62.56 
 
 		 1303 aa  1500    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.21 
 
 		 2099 aa  1280    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.83 
 
 		 1150 aa  836    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.88 
 
 		 1458 aa  1489    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  55.39 
 
 		 1792 aa  1237    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  55.94 
 
 		 1468 aa  1401    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.64 
 
 		 1937 aa  1300    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.47 
 
 		 1839 aa  1291    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.59 
 
 		 1479 aa  1477    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4103  ATPase domain-containing protein  55.75 
 
 		 1179 aa  1213    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.972573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.95 
 
 		 1937 aa  1296    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  62.5 
 
 		 1588 aa  1417    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.07 
 
 		 1179 aa  1247    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  52.64 
 
 		 1937 aa  1300    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  55.1 
 
 		 1816 aa  1358    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.42 
 
 		 1936 aa  1293    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3894  putative sensor histidine kinase  64.15 
 
 		 590 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  56.25 
 
 		 1857 aa  1267    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.04 
 
 		 1847 aa  1355    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  60.43 
 
 		 1297 aa  613  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.7 
 
 		 922 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.47 
 
 		 916 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 		 920 aa  512  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  37.8 
 
 		 896 aa  484  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  37.67 
 
 		 896 aa  481  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  37.53 
 
 		 896 aa  481  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  37.53 
 
 		 896 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  37.74 
 
 		 896 aa  480  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 1195 aa  480  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 		 896 aa  479  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  36.99 
 
 		 896 aa  475  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  37.15 
 
 		 896 aa  476  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  36.99 
 
 		 896 aa  475  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  36.88 
 
 		 896 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  59.9 
 
 		 1118 aa  469  9.999999999999999e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 1155 aa  456  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 1201 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 		 1158 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 1159 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  35.96 
 
 		 1158 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 1163 aa  392  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  37.61 
 
 		 1137 aa  392  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 1713 aa  393  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  33.42 
 
 		 1200 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 		 1680 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  36.26 
 
 		 1172 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  36.22 
 
 		 1170 aa  386  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 1177 aa  382  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 		 1356 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  34.45 
 
 		 1278 aa  379  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 		 1168 aa  379  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 		 1216 aa  379  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  34.94 
 
 		 1161 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 1203 aa  373  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 		 1137 aa  374  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 1149 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 1155 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.1 
 
 		 944 aa  365  4e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 		 1145 aa  362  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 1038 aa  362  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 1155 aa  361  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  31.58 
 
 		 1196 aa  358  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 1155 aa  357  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 1158 aa  357  7.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 		 1189 aa  354  5e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4386  histidine kinase  46.27 
 
 		 411 aa  351  5e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 1141 aa  343  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  31.88 
 
 		 1374 aa  342  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 		 1131 aa  339  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 		 1143 aa  338  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1195 aa  337  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 		 1165 aa  337  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1162 aa  335  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 1194 aa  332  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 1361 aa  317  9e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.87 
 
 		 1161 aa  316  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 1142 aa  312  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>