More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0259 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  100 
 
 		 295 aa  578  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4158  ribokinase  68.37 
 
 		 301 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0695289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  63.1 
 
 		 299 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  44.26 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  50.69 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  46.28 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  42 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  49.83 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  45.18 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  44.74 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  48.52 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  47.32 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  44 
 
 		 305 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  43.67 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  45.3 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  44.52 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1202  ribokinase-like domain-containing protein  49.66 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.744137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  43 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  44.52 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  44.52 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  46.31 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  46.49 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  42.72 
 
 		 308 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  38.94 
 
 		 345 aa  205  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  42.38 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  47.04 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  47.04 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  47.04 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  46.36 
 
 		 299 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  43.19 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  45 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  43.67 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  42.57 
 
 		 305 aa  198  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  45.61 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  37.62 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  43.75 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  42 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  43.18 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  43.05 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  44.04 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  43.23 
 
 		 302 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  46.6 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  43.81 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  41.58 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  41.67 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  42.72 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  39 
 
 		 309 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  42.07 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  37.21 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  43 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  43.45 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  43.1 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  43.1 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  43.1 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  44.97 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  38.28 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  41.95 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  43.1 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  42.76 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  43.1 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  43.1 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  43.05 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  42.76 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  42.86 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  42.52 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  38.64 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  44.64 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  42.86 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  36.79 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  45.33 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  42.67 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  45.39 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  45.21 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  45.21 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  42.28 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  41.78 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  42.14 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  42.38 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  42.72 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  42.14 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  42.38 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  42.67 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  42.38 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  42.14 
 
 		 314 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  44.41 
 
 		 285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  44.41 
 
 		 285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  44.41 
 
 		 285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  41.81 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  43.71 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  44.59 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  42.05 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  39.49 
 
 		 317 aa  182  8.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  41.81 
 
 		 309 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  41.81 
 
 		 309 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  41.81 
 
 		 314 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  41.81 
 
 		 309 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  43.09 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  41.47 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  39.26 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  44.48 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>