More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0257 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  100 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  59.73 
 
 		 270 aa  275  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  59.21 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 		 242 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.07 
 
 		 239 aa  260  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.93 
 
 		 241 aa  258  8e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.11 
 
 		 240 aa  258  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.78 
 
 		 231 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  56.25 
 
 		 233 aa  255  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  56.12 
 
 		 246 aa  255  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  54.04 
 
 		 233 aa  254  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.36 
 
 		 230 aa  254  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  55.46 
 
 		 239 aa  254  7e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  54.04 
 
 		 233 aa  254  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  54.08 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.75 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  55.84 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  58.67 
 
 		 229 aa  251  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  54.13 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.45 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  58.22 
 
 		 242 aa  248  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  54.59 
 
 		 236 aa  248  6e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  56.14 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  50.64 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 		 244 aa  245  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 235 aa  244  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.62 
 
 		 236 aa  243  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  54.59 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  49.36 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  51.72 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  51.72 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.02 
 
 		 236 aa  238  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  51.72 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  51.07 
 
 		 406 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.69 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.84 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  50.87 
 
 		 247 aa  234  7e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 		 236 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  55.02 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52 
 
 		 271 aa  231  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  52.19 
 
 		 252 aa  231  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  47.33 
 
 		 241 aa  230  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  49.36 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.44 
 
 		 273 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.09 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  50 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.78 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  52 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  50.89 
 
 		 286 aa  218  7e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.75 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  47.14 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 		 224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 231 aa  208  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  47.16 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  47.16 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  47.16 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 		 224 aa  204  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.66 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  48.23 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.53 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 232 aa  202  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 226 aa  201  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.81 
 
 		 242 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 255 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.67 
 
 		 229 aa  198  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.2 
 
 		 254 aa  194  7e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 229 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  46.46 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>