More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0250 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  100 
 
 
753 aa  1518    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  56.18 
 
 
754 aa  778    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  68.43 
 
 
765 aa  999    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  55.09 
 
 
744 aa  753    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  54.33 
 
 
743 aa  738    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  36.79 
 
 
776 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  31.26 
 
 
713 aa  239  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.78 
 
 
817 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.23 
 
 
573 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.02 
 
 
1045 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 
697 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  30.09 
 
 
1039 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.06 
 
 
616 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.12 
 
 
579 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.48 
 
 
952 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  29.24 
 
 
591 aa  190  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  29.75 
 
 
855 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  38.56 
 
 
713 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.41 
 
 
750 aa  174  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  29.77 
 
 
574 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  31.71 
 
 
688 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  30.07 
 
 
722 aa  165  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
1711 aa  160  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  32.65 
 
 
1225 aa  159  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
607 aa  159  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  32.54 
 
 
594 aa  157  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  32.43 
 
 
866 aa  156  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  32.3 
 
 
932 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  30.28 
 
 
570 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  36.67 
 
 
1017 aa  151  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  31.88 
 
 
581 aa  150  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  39.3 
 
 
643 aa  148  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
685 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  31.2 
 
 
757 aa  145  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  30.27 
 
 
745 aa  144  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  32.01 
 
 
760 aa  144  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 
865 aa  143  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  32.9 
 
 
1432 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  36.59 
 
 
562 aa  142  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  29.3 
 
 
716 aa  140  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  28.84 
 
 
618 aa  140  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  29.33 
 
 
688 aa  140  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32.43 
 
 
585 aa  138  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  35.45 
 
 
692 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  35.8 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  30.33 
 
 
670 aa  135  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  28.28 
 
 
730 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  32.67 
 
 
580 aa  134  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  34.57 
 
 
528 aa  134  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
1370 aa  133  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  30.37 
 
 
723 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.78 
 
 
583 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.36 
 
 
1332 aa  130  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  29.8 
 
 
700 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  30.84 
 
 
438 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  29.91 
 
 
746 aa  130  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
1361 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  34.54 
 
 
652 aa  128  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  32.4 
 
 
547 aa  128  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.77 
 
 
549 aa  128  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.32 
 
 
738 aa  127  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.57 
 
 
692 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  28.84 
 
 
607 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.81 
 
 
585 aa  126  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.66 
 
 
560 aa  125  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  30.66 
 
 
930 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.54 
 
 
1051 aa  125  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  34.57 
 
 
828 aa  125  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.39 
 
 
697 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.5 
 
 
553 aa  124  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.03 
 
 
523 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  31.16 
 
 
583 aa  123  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35 
 
 
529 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  31.55 
 
 
851 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  30.86 
 
 
721 aa  122  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
1385 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  29.79 
 
 
537 aa  121  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  31 
 
 
956 aa  121  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  30.31 
 
 
693 aa  120  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  30.09 
 
 
658 aa  120  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  29.1 
 
 
512 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
1248 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  28.34 
 
 
771 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  33.93 
 
 
627 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0169  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.83 
 
 
711 aa  118  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00160079  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  28.35 
 
 
425 aa  118  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  29.63 
 
 
693 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  32.05 
 
 
576 aa  115  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  28.74 
 
 
694 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3606  protein serine/threonine phosphatase  34.56 
 
 
395 aa  114  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  28.88 
 
 
805 aa  113  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  27.5 
 
 
676 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  34.66 
 
 
693 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  32.72 
 
 
437 aa  113  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.68 
 
 
655 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.84 
 
 
688 aa  112  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.44 
 
 
590 aa  111  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  34.41 
 
 
488 aa  110  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  28.85 
 
 
366 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
1390 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>