More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0190 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  100 
 
 		 235 aa  485  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  54.78 
 
 		 332 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  55.36 
 
 		 340 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  51.75 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  53.91 
 
 		 162 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  53.91 
 
 		 160 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  43.41 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  50.91 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  51.3 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  53.4 
 
 		 281 aa  118  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  47.75 
 
 		 348 aa  118  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  49.22 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 349 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 452 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 334 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  47.79 
 
 		 400 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  53.76 
 
 		 366 aa  111  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  48.31 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  50.98 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  51.02 
 
 		 417 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 348 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  49.47 
 
 		 372 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  49.47 
 
 		 372 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  49.52 
 
 		 337 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  45.92 
 
 		 348 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45 
 
 		 438 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  50.41 
 
 		 432 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  45.92 
 
 		 363 aa  108  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.08 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  50.41 
 
 		 432 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  49.09 
 
 		 342 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 348 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 348 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  48.94 
 
 		 378 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  48.94 
 
 		 378 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  47.42 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  48.42 
 
 		 372 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 363 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  46.49 
 
 		 150 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  44.9 
 
 		 363 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  46.94 
 
 		 459 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  43.17 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  45.92 
 
 		 370 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  43.22 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  44.21 
 
 		 361 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  44.21 
 
 		 361 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  50 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  47.57 
 
 		 453 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  51.58 
 
 		 380 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 204 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  41.01 
 
 		 501 aa  101  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  39.84 
 
 		 340 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  38.28 
 
 		 424 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5763  NLP/P60 protein  47.12 
 
 		 362 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  44.33 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 150 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  42.37 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 446 aa  99.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.07 
 
 		 388 aa  99  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  39.44 
 
 		 553 aa  99  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  44.12 
 
 		 317 aa  99  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  41.01 
 
 		 517 aa  98.6  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 164 aa  98.6  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  45.63 
 
 		 368 aa  98.2  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  42.52 
 
 		 273 aa  97.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  41.32 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  35.68 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  41.6 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  47.57 
 
 		 398 aa  97.1  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  40.5 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  43 
 
 		 323 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.35 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  46.23 
 
 		 319 aa  96.3  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  37.84 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 388 aa  95.9  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  43.88 
 
 		 330 aa  95.9  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  40.5 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 333 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  39.67 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  39.67 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  39.17 
 
 		 188 aa  95.5  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  39.67 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  38.3 
 
 		 549 aa  95.5  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  39.67 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  39.67 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  39.67 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  39.67 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  36.11 
 
 		 1048 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  45.22 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  45.22 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  45.22 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>