More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0189 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  100 
 
 		 339 aa  666    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  56.17 
 
 		 326 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  59.67 
 
 		 320 aa  289  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  48.47 
 
 		 314 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  50.51 
 
 		 320 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  50.31 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  43.89 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  43.43 
 
 		 301 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  40.72 
 
 		 317 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  42.76 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  42.01 
 
 		 343 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  41.16 
 
 		 329 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  40.4 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  40.2 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  40.39 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  40.58 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  30.94 
 
 		 313 aa  165  8e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  38.73 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  38.73 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  41.08 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  38.73 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  40.76 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.76 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  38.56 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.45 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.76 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  38.41 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  39.01 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  39.24 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  37.46 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  37.62 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  37.38 
 
 		 314 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  38.82 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  35.86 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  37.62 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  36.89 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  37.29 
 
 		 316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  38.51 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  38.05 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  36.88 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  34.75 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  36.61 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  36.21 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  34.42 
 
 		 312 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  37.54 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  36.3 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  35 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  41.24 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  39.81 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  33.88 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  35.59 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  35.44 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  35.48 
 
 		 314 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  37.91 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.31 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  36.07 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  36.36 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  33.44 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  35.35 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.9 
 
 		 320 aa  129  9.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  36.33 
 
 		 318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  33.58 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  32.8 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.73 
 
 		 291 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  34.52 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  30.9 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  31.15 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  33.77 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  31.91 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  31.91 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  34.32 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.8 
 
 		 270 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  31.48 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  31.7 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  29.81 
 
 		 313 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.35 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  29.72 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  35.08 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  31.7 
 
 		 308 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  32.03 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  27.06 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  34.1 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  34.1 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  34.1 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  34.1 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  31.51 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  31.51 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  28.95 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.36 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  34.1 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  34.1 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  34.1 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  25.49 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.33 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.87 
 
 		 312 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  25.08 
 
 		 342 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>