More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0150 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  72.83 
 
 
293 aa  388  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  63.02 
 
 
262 aa  333  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  57.84 
 
 
304 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  61.36 
 
 
265 aa  311  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  61.6 
 
 
269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  59.93 
 
 
266 aa  295  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  56.06 
 
 
284 aa  295  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  57.75 
 
 
278 aa  291  8e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  56.27 
 
 
276 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  54.41 
 
 
362 aa  288  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  55.3 
 
 
269 aa  278  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  53.79 
 
 
274 aa  277  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  55.64 
 
 
283 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  52.99 
 
 
316 aa  272  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  51.71 
 
 
282 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  54.89 
 
 
299 aa  265  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  52.54 
 
 
274 aa  262  4.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  55.04 
 
 
268 aa  259  4e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  55.04 
 
 
277 aa  256  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  53.31 
 
 
286 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  51.75 
 
 
300 aa  254  8e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
256 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  39.91 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  36.32 
 
 
260 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.94 
 
 
236 aa  91.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  36.26 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  37.22 
 
 
269 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  31.72 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  32.6 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.88 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  34.41 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  41.32 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
257 aa  79  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  31.44 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  27.75 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  31.61 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  34.01 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  35.75 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  26.64 
 
 
251 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  29.19 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  45.37 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  29.19 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  30.05 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  45.79 
 
 
239 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  30.05 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  30.05 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  30.05 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  30.05 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  30.05 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  30.05 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  39.64 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  39.64 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  29.73 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  28.65 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  24.89 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  24.89 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  30.19 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  29.19 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  38.98 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  24.89 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  30.19 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  29.19 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  30.19 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  30.19 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  30.19 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  24.89 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  28.65 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  29.88 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  29.83 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  43.75 
 
 
347 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  24.45 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  24.45 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.52 
 
 
256 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  27.96 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.69 
 
 
241 aa  72  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.02 
 
 
256 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 
284 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.59 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.02 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
246 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  42.74 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  30.04 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  40.37 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  29.38 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  41.67 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  44.07 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.5 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  44.64 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>