More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0136 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 432 aa  856    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  74.19 
 
 		 419 aa  597  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  67.59 
 
 		 403 aa  475  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  63.82 
 
 		 406 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  62.97 
 
 		 407 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  58.63 
 
 		 420 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  58.09 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  49.38 
 
 		 409 aa  363  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  50.12 
 
 		 414 aa  363  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  51.13 
 
 		 409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  52.62 
 
 		 406 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  52.63 
 
 		 419 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  50.36 
 
 		 421 aa  350  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  51.71 
 
 		 380 aa  348  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  52.14 
 
 		 410 aa  344  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  51 
 
 		 410 aa  342  5e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  52.64 
 
 		 419 aa  330  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  51.63 
 
 		 417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  51.63 
 
 		 417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  51.63 
 
 		 417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  53.2 
 
 		 306 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  53.2 
 
 		 306 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  40.34 
 
 		 410 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  40.83 
 
 		 410 aa  280  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  41.65 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  41.02 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  39.31 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  39.07 
 
 		 413 aa  270  2.9999999999999997e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  40.62 
 
 		 412 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  41.83 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  40.79 
 
 		 415 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  43.31 
 
 		 411 aa  268  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  40.74 
 
 		 404 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  40.35 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  40.74 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  41.73 
 
 		 418 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  40 
 
 		 404 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  38.39 
 
 		 410 aa  265  8.999999999999999e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  41.06 
 
 		 398 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  40.93 
 
 		 418 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  40.88 
 
 		 404 aa  262  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  38.98 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  40.92 
 
 		 429 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  41.18 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  38.65 
 
 		 438 aa  256  6e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  39.71 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  40.34 
 
 		 405 aa  249  5e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  40.34 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  39.61 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  52.48 
 
 		 297 aa  243  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  40.79 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  40 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  37.43 
 
 		 400 aa  229  8e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  48.91 
 
 		 297 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  52.73 
 
 		 326 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  52.73 
 
 		 326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  52.73 
 
 		 326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  51.33 
 
 		 322 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  51.33 
 
 		 322 aa  212  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  51.33 
 
 		 322 aa  212  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  51.33 
 
 		 322 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  51.33 
 
 		 322 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  51.33 
 
 		 322 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  51.33 
 
 		 322 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  51.33 
 
 		 322 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  51.33 
 
 		 322 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  49.18 
 
 		 322 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  49.18 
 
 		 322 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  49.18 
 
 		 322 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  49.18 
 
 		 322 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  49.18 
 
 		 322 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  48.37 
 
 		 435 aa  209  8e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  49.77 
 
 		 400 aa  209  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  49.79 
 
 		 325 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  49.77 
 
 		 400 aa  209  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  50.66 
 
 		 325 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  50 
 
 		 322 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  48.16 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  52.91 
 
 		 215 aa  207  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  47.76 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  46.64 
 
 		 357 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  44.36 
 
 		 326 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  49.79 
 
 		 284 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  44.75 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  53.89 
 
 		 213 aa  202  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  44.57 
 
 		 299 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  44.33 
 
 		 292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  48.94 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  54.68 
 
 		 223 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21750  phosphoserine phosphatase SerB  56.8 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.875318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  43.13 
 
 		 291 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  41.84 
 
 		 291 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  46.8 
 
 		 279 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  50.24 
 
 		 306 aa  196  8.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  48.88 
 
 		 302 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  50.49 
 
 		 328 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  49.15 
 
 		 281 aa  196  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  48.02 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  51.71 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  48.03 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>