More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0132 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  100 
 
 		 311 aa  625  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  59.87 
 
 		 307 aa  358  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  60.47 
 
 		 308 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  59.26 
 
 		 301 aa  352  4e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  57.81 
 
 		 494 aa  345  5e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  56.81 
 
 		 304 aa  332  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  54.1 
 
 		 349 aa  321  9.000000000000001e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  54.64 
 
 		 308 aa  321  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  50.33 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  47.49 
 
 		 299 aa  285  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  50.8 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  49.5 
 
 		 308 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  48.17 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  50.48 
 
 		 310 aa  275  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  47.21 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  49.16 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  46.08 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  45.89 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  43.35 
 
 		 319 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  47.33 
 
 		 298 aa  237  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.681258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  44.05 
 
 		 317 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  44.05 
 
 		 317 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  44.05 
 
 		 317 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  42.72 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  46.05 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  42.44 
 
 		 322 aa  232  6e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  40.79 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  39.05 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.67 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  40.3 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  35.81 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 		 307 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  40.27 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  35.5 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  34.12 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  33.78 
 
 		 328 aa  142  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 287 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  35.42 
 
 		 289 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  33.55 
 
 		 341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 291 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  38.5 
 
 		 270 aa  125  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  32.13 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  31.33 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  33.44 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 281 aa  119  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  34.01 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  29.1 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 289 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  49.17 
 
 		 350 aa  112  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 288 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.67 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  30.67 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  30.84 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0522  Alpha/beta hydrolase fold-1  37.85 
 
 		 241 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  44.26 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  35.98 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  28.84 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>