More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0109 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  100 
 
 
801 aa  1637  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  68.15 
 
 
789 aa  1062  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  54.84 
 
 
892 aa  745  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  50.07 
 
 
773 aa  682  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  50.64 
 
 
739 aa  629  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  46.84 
 
 
744 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.7 
 
 
747 aa  588  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.61 
 
 
737 aa  583  1e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  44.46 
 
 
820 aa  567  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  41.6 
 
 
807 aa  545  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.49 
 
 
759 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  47.21 
 
 
1057 aa  539  1e-152  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.28 
 
 
736 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  43.06 
 
 
784 aa  505  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  43.4 
 
 
819 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  43.52 
 
 
880 aa  491  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  41.19 
 
 
740 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  39.67 
 
 
871 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  39.11 
 
 
877 aa  448  1e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  36.72 
 
 
833 aa  447  1e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  37.48 
 
 
821 aa  436  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.71 
 
 
821 aa  428  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  37.86 
 
 
727 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  38.82 
 
 
838 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  38.58 
 
 
763 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.22 
 
 
705 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 
758 aa  416  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  38.98 
 
 
807 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 
766 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  36.18 
 
 
772 aa  412  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  39.22 
 
 
721 aa  407  1e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 
801 aa  402  1e-110  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
723 aa  399  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  39.85 
 
 
758 aa  395  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.28 
 
 
766 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  35.49 
 
 
808 aa  385  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  37.44 
 
 
765 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.69 
 
 
817 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  34.41 
 
 
771 aa  372  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  37.88 
 
 
680 aa  360  8e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  32.96 
 
 
830 aa  350  7e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  34.29 
 
 
768 aa  349  1e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  36.73 
 
 
726 aa  348  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  34.78 
 
 
814 aa  347  7e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  37.15 
 
 
710 aa  342  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.09 
 
 
727 aa  342  2e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 
710 aa  338  2e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  39.62 
 
 
703 aa  335  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  37.88 
 
 
761 aa  333  7e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  34.17 
 
 
773 aa  333  7e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  34.19 
 
 
722 aa  328  2e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.27 
 
 
695 aa  328  2e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.86 
 
 
816 aa  328  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.62 
 
 
840 aa  322  2e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  38.39 
 
 
700 aa  321  4e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  9.48759e-05 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  33.43 
 
 
806 aa  311  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  33.42 
 
 
828 aa  310  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  35.54 
 
 
661 aa  310  7e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  34.89 
 
 
693 aa  309  1e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.66 
 
 
720 aa  309  2e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  34.59 
 
 
723 aa  308  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
817 aa  306  8e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
818 aa  305  2e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
824 aa  305  2e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 
816 aa  304  5e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
831 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
830 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
831 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  32.42 
 
 
810 aa  301  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
816 aa  301  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
816 aa  301  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  34.35 
 
 
710 aa  298  3e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.68 
 
 
761 aa  294  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  34.43 
 
 
648 aa  292  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  31.66 
 
 
750 aa  291  4e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  34.48 
 
 
905 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
695 aa  285  2e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  32.09 
 
 
643 aa  285  2e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  32.09 
 
 
643 aa  285  2e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  32.75 
 
 
811 aa  284  4e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  31.39 
 
 
643 aa  284  6e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  30.52 
 
 
774 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.54 
 
 
618 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  31.89 
 
 
765 aa  278  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  32.52 
 
 
649 aa  276  1e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  31.4 
 
 
836 aa  275  2e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  34.7 
 
 
710 aa  275  2e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  31.81 
 
 
626 aa  272  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  34.25 
 
 
750 aa  272  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  31.85 
 
 
625 aa  271  3e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  31.62 
 
 
648 aa  270  6e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  31.05 
 
 
727 aa  270  9e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  31.3 
 
 
719 aa  268  3e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  31.47 
 
 
776 aa  268  3e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  32.81 
 
 
751 aa  268  4e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  31.4 
 
 
708 aa  267  6e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  32.51 
 
 
705 aa  266  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  34.49 
 
 
764 aa  262  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  34.07 
 
 
726 aa  263  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  33.17 
 
 
658 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>