57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0091 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  54.24 
 
 
63 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  49.15 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  52.46 
 
 
63 aa  58.9  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  56.86 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  54 
 
 
79 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  47.62 
 
 
77 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  50.98 
 
 
60 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  51.06 
 
 
55 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 
63 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  47.06 
 
 
60 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0393  hypothetical protein  66.67 
 
 
63 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  53.19 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  48 
 
 
58 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  44.44 
 
 
67 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 
63 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  48.39 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  47.17 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  45.1 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  41.82 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  40.32 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  45.31 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  47.92 
 
 
57 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  49.02 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  44.68 
 
 
59 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
62 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  42 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  53.06 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  50.85 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  48.94 
 
 
56 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  44 
 
 
57 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  44.9 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  46 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  39.62 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  51.85 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2308  protein of unknown function DUF397  48.84 
 
 
60 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  42 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1652  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
59 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0828203  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  49.02 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  38.71 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  46.81 
 
 
57 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  46 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0215  hypothetical protein  51.02 
 
 
60 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  36.67 
 
 
67 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5993  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 
64 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  44.68 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 
59 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  43.75 
 
 
56 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  44.9 
 
 
57 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  47.17 
 
 
75 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>