25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0085 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0085  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  306  9e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.623619  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  46.21 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0523  hypothetical protein  43.45 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680982  hitchhiker  0.005662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0436  hypothetical protein  43.36 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5195  hypothetical protein  39.57 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0603598  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0304  hypothetical protein  38.13 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  32.59 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  31.69 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  35.44 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5763  hypothetical protein  31.13 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66450  hypothetical protein  29.31 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2965  hypothetical protein  32.84 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0165081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  24.44 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  32.05 
 
 		 335 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  27.87 
 
 		 184 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  29.89 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  32.05 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  32.05 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  32.05 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  32.05 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>