164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0084 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  490  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  74.49 
 
 		 243 aa  338  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  68.88 
 
 		 245 aa  328  7e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  57.74 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  55.19 
 
 		 242 aa  248  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  56.43 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  56.43 
 
 		 256 aa  246  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  53.72 
 
 		 245 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  52.32 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  57.63 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  47.17 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17590  uncharacterized LmbE-like protein  45.87 
 
 		 241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  43.84 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2405  LmbE family protein  43.22 
 
 		 222 aa  138  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  41.39 
 
 		 423 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  41.46 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  40.17 
 
 		 239 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  43 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  34.78 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  40.41 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  38.24 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  39.06 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  33.16 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  33.48 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  34.67 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  36.89 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  32.32 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  33.62 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  32.83 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  32.99 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  36.73 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  32.66 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  32.16 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  36.13 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  31.4 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  36.72 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  34.81 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  35.59 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  36.97 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  31.61 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  27.88 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  27.67 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  31.25 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  30.99 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  30.99 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  30.92 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  27.23 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  34.59 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  28.57 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  28.14 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  30.94 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  28.64 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  34.33 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  26.96 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  29.13 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  36.17 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  27.82 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  33.56 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  27.4 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  31.94 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  35.63 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  29.61 
 
 		 217 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  28.27 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  32.53 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  31.28 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  36.8 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  27.52 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  28.67 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  28.06 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04810  uncharacterized LmbE-like protein  28.92 
 
 		 923 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.970372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  25.99 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  25.99 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  25.99 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  25.99 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  25.99 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  25.22 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  32.37 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  25.11 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  30.5 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  27.87 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  25.99 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  25.99 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  31.62 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  34.51 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  27.86 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  27.86 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  26.04 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  29.7 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  25.99 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  25.99 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  29.74 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  25.99 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  29.47 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  26.2 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  28.57 
 
 		 1071 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3903  LmbE-like protein  28.18 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.704498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  25.64 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  29.5 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  32.26 
 
 		 306 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  32.12 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>