More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0078 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0078  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  100 
 
 		 374 aa  715    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0042  inner-membrane translocator  72.99 
 
 		 375 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0152967  normal  0.0556674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7908  inner-membrane translocator  59.57 
 
 		 388 aa  312  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0421  inner-membrane translocator  48.9 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3914  inner-membrane translocator  49.33 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.347928  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 358 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3800  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1383  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  32.58 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1402  inner-membrane translocator  29.36 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.744825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  34.49 
 
 		 594 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4108  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 333 aa  119  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3167  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581238  normal  0.308914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  33.08 
 
 		 368 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 652 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0224  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  36.05 
 
 		 332 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 343 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 329 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 340 aa  113  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  34.62 
 
 		 597 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1401  inner-membrane translocator  28.85 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1513  inner-membrane translocator  29.6 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4227  urea ABC transporter, permease protein UrtC  28.93 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.338662  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1860  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22716 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  32.37 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 324 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3425  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  34.96 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  28.91 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.73 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 324 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2932  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.303159  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  28.95 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  30.49 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.29 
 
 		 656 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 		 331 aa  107  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  32.31 
 
 		 340 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 315 aa  107  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4169  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 433 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 309 aa  106  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.53 
 
 		 333 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  33.74 
 
 		 323 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2422  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  30.3 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  31.49 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  33.48 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  32.93 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2014  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.53 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.383431  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  33.06 
 
 		 646 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.37 
 
 		 646 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4566  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2955  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678807  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1946  inner-membrane translocator  30.75 
 
 		 411 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.43 
 
 		 646 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  33.2 
 
 		 330 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1839  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2761  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 411 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1572  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0827  putative membrane protein of urea ABC transport system  29.41 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08841  putative membrane protein of urea ABC transport system  29.1 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  28.86 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1578  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3133  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0698666  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3716  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08861  putative membrane protein of urea ABC transport system  29.1 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>