More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0075 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0075  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  100 
 
 		 257 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0039  ABC transporter related protein  82.64 
 
 		 290 aa  371  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0187406  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7911  ABC transporter related  61.42 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  51.42 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  48.24 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.17 
 
 		 257 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 257 aa  207  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  43.33 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 257 aa  204  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 257 aa  204  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  46.37 
 
 		 267 aa  198  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  45.49 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  43.92 
 
 		 256 aa  195  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  43.09 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  43.98 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  42 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  43.55 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  44.67 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0330  ABC transporter related  44.31 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  44.44 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  43.43 
 
 		 255 aa  188  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  44.3 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  44.44 
 
 		 254 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  45.45 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  40.75 
 
 		 294 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  41.7 
 
 		 254 aa  188  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  44.44 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  39.68 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  44.4 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 		 254 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  42.8 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  42.13 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  43.44 
 
 		 484 aa  184  8e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  44.9 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  43.15 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  41.46 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  44.08 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  42.91 
 
 		 859 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  39.27 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  39.27 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  43.03 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  41.67 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  43.72 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  40.15 
 
 		 266 aa  181  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  36.47 
 
 		 266 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  43.09 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.94 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  40.08 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  42.68 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  41.3 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  43.55 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 		 264 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  39.36 
 
 		 253 aa  178  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  41.39 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  40.4 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  42.8 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  42.57 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  37.6 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  39.27 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  39.59 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 		 259 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  38.1 
 
 		 269 aa  175  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0668  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  40.86 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  40.32 
 
 		 250 aa  175  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  41.7 
 
 		 261 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  40.98 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  39.53 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  40.98 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  40.49 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  40.48 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  40.57 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3152  ABC transporter related  41.15 
 
 		 943 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  37.55 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  39.53 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  40.61 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  42.11 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  39.15 
 
 		 250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  40.24 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  37.93 
 
 		 270 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  42.57 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  43.9 
 
 		 852 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1335  ABC transporter related  40.98 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0569483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  36.8 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  39.45 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1296  ABC transporter related  40.98 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  37.2 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  37.7 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  40.82 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4463  ABC transporter related  39.26 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.236919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2430  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.96 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  43.9 
 
 		 244 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>