More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0067 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0067  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
256 aa  513  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2497  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.56 
 
 
255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4083  enoyl-CoA hydratase  40.56 
 
 
250 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00898216  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3696  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592962  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3623  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0079927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3990  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.44 
 
 
267 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592711  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3628  enoyl-CoA hydratase  41.27 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.53 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 
263 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12507  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.8945800000000003e-40  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.38 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
268 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.78 
 
 
273 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
261 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2557  enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 
250 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6663  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
253 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.258575  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  38.36 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
259 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0176  enoyl-CoA hydratase  38.79 
 
 
248 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.99 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  32.94 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
261 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
263 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  31.27 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
263 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
258 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
264 aa  125  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  31.8 
 
 
265 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
259 aa  125  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.63 
 
 
260 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
259 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
260 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
262 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 
264 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
267 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
270 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
260 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.79 
 
 
651 aa  123  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
260 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0400  short chain enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 
270 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0904838  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
267 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 
259 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
262 aa  122  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
268 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8352  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.8 
 
 
261 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.948817 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
280 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
266 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  30.08 
 
 
261 aa  122  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 
262 aa  122  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
262 aa  121  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
268 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
260 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.07 
 
 
259 aa  119  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 
261 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6084  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.08 
 
 
258 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
257 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
257 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
259 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  37.72 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.23 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
257 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 
274 aa  118  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
259 aa  118  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 
266 aa  118  9e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  37.61 
 
 
260 aa  118  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.92 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0454555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>