More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0060 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  100 
 
 
465 aa  945    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  47.07 
 
 
468 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.12 
 
 
444 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  43.78 
 
 
465 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  38.01 
 
 
461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  37.15 
 
 
474 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.72 
 
 
472 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  36.19 
 
 
479 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.15 
 
 
461 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  36.62 
 
 
458 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  39.35 
 
 
465 aa  293  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  35.78 
 
 
479 aa  293  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  37.61 
 
 
499 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  38.79 
 
 
463 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  35.42 
 
 
461 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.29 
 
 
479 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  35.55 
 
 
479 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  37.64 
 
 
459 aa  288  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.32 
 
 
464 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  38.95 
 
 
602 aa  286  7e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  39.61 
 
 
461 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.12 
 
 
461 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  40.49 
 
 
460 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  39.65 
 
 
476 aa  280  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  38.43 
 
 
477 aa  276  5e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  38.97 
 
 
465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  38.74 
 
 
469 aa  272  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  34.44 
 
 
473 aa  272  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  38.96 
 
 
456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  39.52 
 
 
465 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  35.7 
 
 
462 aa  262  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  37.2 
 
 
463 aa  260  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.85 
 
 
465 aa  259  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  36.77 
 
 
478 aa  256  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  39.26 
 
 
466 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  34.61 
 
 
470 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  35.62 
 
 
462 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  38 
 
 
461 aa  249  6e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.36 
 
 
478 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  40.04 
 
 
466 aa  248  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  36.89 
 
 
456 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  35.85 
 
 
456 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  34.9 
 
 
473 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  37.9 
 
 
477 aa  237  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  33.26 
 
 
473 aa  236  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.59 
 
 
448 aa  226  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  34.63 
 
 
461 aa  216  9e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.98 
 
 
469 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  28.07 
 
 
448 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.32 
 
 
481 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.74 
 
 
466 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  26.98 
 
 
444 aa  176  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  26.55 
 
 
444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  30.75 
 
 
462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  32.52 
 
 
449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  33.4 
 
 
446 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.06 
 
 
726 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.15 
 
 
484 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.41 
 
 
490 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  29.03 
 
 
448 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.25 
 
 
705 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  30.42 
 
 
474 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.1 
 
 
492 aa  153  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.94 
 
 
734 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.95 
 
 
490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  31.78 
 
 
436 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.34 
 
 
472 aa  146  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 
459 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  34.22 
 
 
450 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.32 
 
 
462 aa  143  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.26 
 
 
474 aa  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.02 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  36.33 
 
 
467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  30.47 
 
 
470 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  30.22 
 
 
487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  32.09 
 
 
752 aa  140  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  30.89 
 
 
495 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  29.3 
 
 
462 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.3 
 
 
462 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  33.12 
 
 
458 aa  137  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
758 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  28.13 
 
 
532 aa  136  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  29.46 
 
 
465 aa  136  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  28.63 
 
 
753 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  37.22 
 
 
439 aa  133  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  38.89 
 
 
472 aa  133  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  31.53 
 
 
447 aa  133  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  27.83 
 
 
596 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  30.25 
 
 
473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.99 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.54 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.22 
 
 
449 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  28.3 
 
 
459 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  28.35 
 
 
468 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  42.25 
 
 
764 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  40.87 
 
 
754 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  34.67 
 
 
436 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  32.99 
 
 
448 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.76 
 
 
456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>