More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0055 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  408  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  51.44 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  46.27 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  47.32 
 
 		 197 aa  165  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  49.76 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  44.61 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  45.12 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  39.71 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  40.26 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  48.12 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  40.37 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  41.61 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  38.67 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  35.47 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  34.73 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  45.86 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  45.59 
 
 		 210 aa  97.8  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  39.16 
 
 		 544 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  39.33 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  41.77 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  36.08 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  39.44 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  31.41 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  31.41 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  40.79 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  38.85 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  44.36 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  44.14 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  32.05 
 
 		 199 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 167 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  46.38 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  35.06 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  31.41 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  42.03 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  37.58 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  39.61 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  39.57 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  40.6 
 
 		 190 aa  88.2  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 149 aa  88.2  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  37.5 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  41.35 
 
 		 190 aa  88.2  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  38.97 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  37.56 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  36.31 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  33.77 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  40.88 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  31.85 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  40.29 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  31.82 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  40.74 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  34.91 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  33.14 
 
 		 217 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  42.28 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  36.09 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  35.76 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  38.52 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  32.93 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  40.88 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  36.11 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  35.38 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  36.02 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  39.42 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  30.72 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  37.97 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  43.75 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  37.97 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  33.54 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  36.05 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  34.09 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  34.47 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  34.47 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  34.47 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  27.61 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  31.8 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  36.88 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  38.62 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  35.17 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  35.07 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  32.12 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  38.97 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  33.57 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  43.81 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>