47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0050 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  920    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  56.8 
 
 
456 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  55.58 
 
 
440 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  39.52 
 
 
465 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  39.72 
 
 
421 aa  279  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  37.33 
 
 
422 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  37.44 
 
 
422 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  34.35 
 
 
417 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  33.88 
 
 
422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  35.32 
 
 
435 aa  233  6e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  34.72 
 
 
425 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  34.73 
 
 
431 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  33.11 
 
 
429 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  31.93 
 
 
438 aa  209  9e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  32.35 
 
 
435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  31.82 
 
 
433 aa  192  7e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  30.98 
 
 
447 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  30.7 
 
 
426 aa  172  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  27.1 
 
 
459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  27.43 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  45.7 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  26.86 
 
 
448 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  25.05 
 
 
432 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  26.86 
 
 
448 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  26.51 
 
 
454 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  26.7 
 
 
394 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  27.33 
 
 
405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  25.23 
 
 
394 aa  99  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  24.87 
 
 
400 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  25.33 
 
 
380 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  25.17 
 
 
407 aa  90.5  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  23.92 
 
 
407 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  23.8 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  29.84 
 
 
449 aa  71.2  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  20.79 
 
 
437 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  23.37 
 
 
445 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  25.93 
 
 
458 aa  50.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1530  abortive infection protein  37.5 
 
 
392 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00764911  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  28.3 
 
 
1175 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  29.25 
 
 
1204 aa  48.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  23.25 
 
 
419 aa  47  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2523  abortive infection protein  21.6 
 
 
478 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.237288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  28.15 
 
 
595 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  27.36 
 
 
1182 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0024  recombination protein RecR  26.12 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  27.36 
 
 
1171 aa  44.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  26.67 
 
 
1181 aa  43.5  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>