More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0044 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  100 
 
 
199 aa  396  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  88.44 
 
 
199 aa  358  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  84.85 
 
 
199 aa  341  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  84.85 
 
 
199 aa  339  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  82.83 
 
 
199 aa  339  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  81.31 
 
 
199 aa  338  4e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  84.34 
 
 
199 aa  333  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  81.73 
 
 
199 aa  329  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  81.22 
 
 
202 aa  329  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  79.8 
 
 
199 aa  328  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  77.78 
 
 
199 aa  326  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  78.79 
 
 
199 aa  324  5e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  79.19 
 
 
199 aa  321  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  77.27 
 
 
199 aa  320  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  78.17 
 
 
199 aa  318  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  77.16 
 
 
204 aa  318  3e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  78.17 
 
 
197 aa  315  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  77.66 
 
 
197 aa  315  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  77.16 
 
 
199 aa  313  9e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  75.38 
 
 
199 aa  313  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  76.41 
 
 
199 aa  310  9e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  74.87 
 
 
199 aa  309  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  74.11 
 
 
199 aa  307  6.999999999999999e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  74.37 
 
 
202 aa  302  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  73.1 
 
 
197 aa  299  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  73.23 
 
 
198 aa  297  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0203  recombination protein RecR  72.73 
 
 
197 aa  294  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  70.56 
 
 
199 aa  288  4e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13747  recombination protein RecR  66.34 
 
 
203 aa  280  7.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.24685  normal  0.507184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5527  recombination protein RecR  66.83 
 
 
203 aa  276  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5271  recombination protein RecR  65.84 
 
 
203 aa  275  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139044  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4903  recombination protein RecR  65.84 
 
 
203 aa  275  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4992  recombination protein RecR  65.84 
 
 
203 aa  275  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1288  recombination protein RecR  66.34 
 
 
203 aa  274  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404677  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  62.24 
 
 
202 aa  270  8.000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  63.4 
 
 
200 aa  262  2e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  62.69 
 
 
198 aa  257  6e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  62.3 
 
 
203 aa  254  4e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4008  recombination protein RecR  61.88 
 
 
215 aa  254  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  62.63 
 
 
198 aa  253  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  58.67 
 
 
198 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  60.1 
 
 
198 aa  252  2.0000000000000002e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  61.73 
 
 
199 aa  251  4.0000000000000004e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  55.33 
 
 
199 aa  251  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0437  recombination protein RecR  63.86 
 
 
203 aa  249  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  57.87 
 
 
199 aa  248  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  56.63 
 
 
198 aa  247  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  57.65 
 
 
198 aa  246  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  56.63 
 
 
199 aa  247  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  55.1 
 
 
199 aa  244  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  57.89 
 
 
215 aa  240  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  56.7 
 
 
198 aa  239  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  56.7 
 
 
198 aa  239  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  56.7 
 
 
198 aa  239  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  56.7 
 
 
198 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  56.7 
 
 
198 aa  239  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  56.7 
 
 
198 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  56.7 
 
 
198 aa  239  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  56.19 
 
 
198 aa  239  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  56.12 
 
 
198 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  55.1 
 
 
199 aa  238  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  55.1 
 
 
198 aa  237  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  55.1 
 
 
198 aa  237  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  59.9 
 
 
204 aa  237  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  53.85 
 
 
201 aa  237  9e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  55.1 
 
 
198 aa  236  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  56.19 
 
 
198 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  56.19 
 
 
198 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  54.92 
 
 
200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  56.54 
 
 
200 aa  232  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  51.78 
 
 
198 aa  232  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  51.78 
 
 
198 aa  232  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  52.04 
 
 
199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  53.47 
 
 
205 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  52.76 
 
 
199 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  54.69 
 
 
204 aa  228  4e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  55.56 
 
 
199 aa  228  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  54.17 
 
 
204 aa  227  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  55.73 
 
 
198 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  55.73 
 
 
198 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  55.9 
 
 
198 aa  226  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  55.73 
 
 
198 aa  225  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  56.32 
 
 
189 aa  224  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  53.03 
 
 
197 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  53.65 
 
 
204 aa  223  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  53.03 
 
 
197 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  57.22 
 
 
222 aa  222  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  56.12 
 
 
198 aa  223  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  58.67 
 
 
199 aa  221  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  52.85 
 
 
198 aa  221  4.9999999999999996e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  54.84 
 
 
185 aa  220  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0210  recombination protein RecR  55.61 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00238733  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5291  recombination protein RecR  54.07 
 
 
212 aa  218  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  52.76 
 
 
199 aa  217  7.999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  51.78 
 
 
201 aa  217  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0096  recombination protein RecR  56.12 
 
 
197 aa  216  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  50.25 
 
 
198 aa  216  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  52.55 
 
 
198 aa  216  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  51.53 
 
 
199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  52.06 
 
 
219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>