22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0025 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0025  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  320  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4831  hypothetical protein  78.12 
 
 
166 aa  227  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4939  hypothetical protein  69.43 
 
 
162 aa  217  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3538  hypothetical protein  64.56 
 
 
166 aa  201  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9321  hypothetical protein  57.83 
 
 
169 aa  186  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0276  hypothetical protein  44.37 
 
 
161 aa  104  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0533  hypothetical protein  39.61 
 
 
164 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36890  hypothetical protein  39.22 
 
 
160 aa  99.8  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0678553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4049  hypothetical protein  38.61 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0170  hypothetical protein  41.56 
 
 
176 aa  87.8  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7312  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13785  hypothetical protein  36.94 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.632549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5595  hypothetical protein  35.03 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0309  hypothetical protein  36.08 
 
 
179 aa  77.4  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1213  hypothetical protein  34.39 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5342  hypothetical protein  34.84 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428585  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5049  hypothetical protein  34.84 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4961  hypothetical protein  34.84 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9320  hypothetical protein  32.7 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6532  hypothetical protein  30.41 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779684  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0026  hypothetical protein  31.37 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0469  hypothetical protein  29.25 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2019  hypothetical protein  30.39 
 
 
184 aa  41.6  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>