30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0024 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0024    100 
 
 		 519 bp  1029    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0023    100 
 
 		 273 bp  276  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  84.17 
 
 		 654 bp  194  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  83.74 
 
 		 648 bp  133  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  85.47 
 
 		 642 bp  97.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  83.19 
 
 		 639 bp  73.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03330  uracil phosphoribosyltransferase  83.65 
 
 		 639 bp  71.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0471  uracil phosphoribosyltransferase  83.33 
 
 		 636 bp  71.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.09301  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  82.24 
 
 		 639 bp  61.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04490  uracil phosphoribosyltransferase  85.33 
 
 		 639 bp  61.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0207  uracil phosphoribosyltransferase  87.1 
 
 		 636 bp  60  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0671  uracil phosphoribosyltransferase  92.68 
 
 		 633 bp  58  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1556  uracil phosphoribosyltransferase  94.44 
 
 		 633 bp  56  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.394444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  81.73 
 
 		 636 bp  56  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  90.91 
 
 		 636 bp  56  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1905  uracil phosphoribosyltransferase  96.77 
 
 		 627 bp  54  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0822251 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0832  uracil phosphoribosyltransferase  96.67 
 
 		 621 bp  52  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  87.04 
 
 		 657 bp  52  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  88 
 
 		 654 bp  52  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0356  uracil phosphoribosyltransferase  81.72 
 
 		 639 bp  50.1  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.925277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61470  uracil phosphoribosyltransferase  90.24 
 
 		 639 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.273036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41360  uracil phosphoribosyltransferase  90.24 
 
 		 639 bp  50.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0463  uracil phosphoribosyltransferase  90.24 
 
 		 630 bp  50.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1968  uracil phosphoribosyltransferase  96.55 
 
 		 627 bp  50.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.657111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0581  uracil phosphoribosyltransferase  93.75 
 
 		 627 bp  48.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  100 
 
 		 1626 bp  48.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26040  uracil phosphoribosyltransferase  79.83 
 
 		 639 bp  46.1  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1065  uracil phosphoribosyltransferase  91.43 
 
 		 627 bp  46.1  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  80.37 
 
 		 636 bp  46.1  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2255  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 657 bp  46.1  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.549393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>