More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0011 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0011  putative glycosyltransferase  100 
 
 
320 aa  634    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.171814  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0640  glycosyl transferase family 2  54.92 
 
 
321 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3317  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  50.63 
 
 
314 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0842  glycosyl transferase family 2  41.79 
 
 
347 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.752789  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
348 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  26.67 
 
 
326 aa  92  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.05 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.19 
 
 
327 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
276 aa  89.4  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.12 
 
 
327 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
327 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  29 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
327 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.12 
 
 
327 aa  88.2  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  28.12 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  29 
 
 
329 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  28.12 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.31 
 
 
326 aa  86.7  6e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  45.74 
 
 
704 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  35.82 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  40.83 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  25.74 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  39.05 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.49 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
329 aa  79  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
573 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
573 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  43.69 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.73 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  44.35 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  36.36 
 
 
1157 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  29.63 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1197  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
358 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0797043  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.02 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.54 
 
 
334 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.73 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  26.42 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
597 aa  76.3  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  40.44 
 
 
352 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.62 
 
 
314 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  40.19 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  41.75 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  34.29 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  39.64 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  44 
 
 
1015 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.82 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  22.61 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  26.15 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  41.18 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  28.33 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  40.74 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  28.46 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  38.53 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  34.92 
 
 
1250 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0585  beta-1,3-galactosyltransferase  27.23 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 
760 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  20.63 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
358 aa  72.4  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  39.58 
 
 
1177 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0380  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  39.58 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
276 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  39.58 
 
 
1177 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.02 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
528 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3380  glycosyl transferase family protein  46.39 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1227  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.98 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000982569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.95 
 
 
731 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  27.24 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  25.88 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.56 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>