More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0002 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 380 aa  759    Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  77.45 
 
 		 379 aa  566  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  68.95 
 
 		 375 aa  531  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  65.18 
 
 		 379 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  64.4 
 
 		 378 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  56.78 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  58.12 
 
 		 408 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  55.91 
 
 		 379 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  57.33 
 
 		 377 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  56.17 
 
 		 376 aa  423  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0002  DNA polymerase III, beta subunit  54.57 
 
 		 378 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  54.59 
 
 		 376 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5295  DNA polymerase III, beta subunit  55.96 
 
 		 384 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0003  DNA polymerase III, beta subunit  53.81 
 
 		 402 aa  411  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  55.13 
 
 		 387 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  53.3 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  54.86 
 
 		 376 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000849521  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  55.38 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  54.07 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0002  DNA polymerase III, beta subunit  56.81 
 
 		 386 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0003  DNA polymerase III, beta subunit  55.5 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  52.67 
 
 		 388 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0002  DNA polymerase III, beta subunit  55.5 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00244113  unclonable  0.0000000186271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0003  DNA polymerase III, beta subunit  55.91 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000000000316606  hitchhiker  0.00386911 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00020  DNA polymerase III, beta subunit  51.72 
 
 		 378 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  50.64 
 
 		 398 aa  381  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  49.6 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  50.92 
 
 		 365 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  54.35 
 
 		 378 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  50.13 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  51.03 
 
 		 398 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  51.03 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0002  DNA polymerase III, beta subunit  54.33 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435185 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  51.03 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  49.87 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  47.45 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  48.8 
 
 		 408 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0002  DNA polymerase III subunit beta  50.92 
 
 		 380 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00020  DNA polymerase III subunit beta  54.83 
 
 		 379 aa  354  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251098  normal  0.535088 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3544  DNA polymerase III subunit beta  47.75 
 
 		 364 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.908435  normal  0.835762 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1435  DNA polymerase III subunit beta  40.94 
 
 		 374 aa  308  8e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.674698  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0044  DNA polymerase III, beta subunit  38.58 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5871  DNA polymerase III, beta subunit  45.32 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0738  DNA polymerase III beta subunit family protein  41.24 
 
 		 433 aa  285  8e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  34.29 
 
 		 366 aa  206  7e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.59 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.59 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.16 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.84 
 
 		 365 aa  182  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.45 
 
 		 375 aa  182  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.41 
 
 		 365 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.76 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.71 
 
 		 397 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  26.56 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  27.95 
 
 		 377 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.32 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.46 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.46 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.39 
 
 		 385 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.35 
 
 		 385 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.39 
 
 		 385 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.4 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  30.05 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.81 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.76 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  29.44 
 
 		 381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  28.53 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.98 
 
 		 367 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.15 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.53 
 
 		 370 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.57 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  28.61 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.04 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  27 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  26.56 
 
 		 374 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0014  DNA-directed DNA polymerase  27.68 
 
 		 366 aa  150  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000733559  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.49 
 
 		 366 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000544098  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  27.95 
 
 		 378 aa  149  8e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0686  DNA polymerase III, beta subunit  27.62 
 
 		 366 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0347365  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.72 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  27.66 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  27.69 
 
 		 378 aa  147  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  27.69 
 
 		 378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.42 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.42 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.42 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.42 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.83 
 
 		 380 aa  146  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  25.2 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.49 
 
 		 372 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.08 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000318907  decreased coverage  0.000394754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0001  DNA polymerase III, beta subunit  28.08 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.336764  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0662  DNA polymerase III, beta subunit  26.85 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000326321  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.32 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.7 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000472427  hitchhiker  0.00139326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  26.47 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  26.47 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.89 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.44 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0010  DNA polymerase III, beta subunit  26.44 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000642144  hitchhiker  0.00000000134313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>