More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_R0008 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_R0029  23S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 2900 bp  735    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0017  23S ribosomal RNA  83.46 
 
 		 2900 bp  728    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0042  hypothetical protein  100 
 
 		 369 bp  731    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0087  23S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 2900 bp  720    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0903  hypothetical protein  100 
 
 		 369 bp  731    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118462  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0084  23S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 2900 bp  735    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0759493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0031  23S ribosomal RNA  85.7 
 
 		 2946 bp  1045    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0008  23S ribosomal RNA segment  100 
 
 		 3298 bp  6538    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0071  23S ribosomal RNA  85.52 
 
 		 2912 bp  963    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.19372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0058  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2913 bp  955    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00925109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0041  23S ribosomal RNA  85.36 
 
 		 2618 bp  981    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0588399  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0054  23S ribosomal RNA  86.38 
 
 		 2969 bp  1061    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  85.42 
 
 		 2935 bp  1015    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0050  23S ribosomal RNA  85.8 
 
 		 2935 bp  932    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0010  23S ribosomal RNA  85.8 
 
 		 2934 bp  932    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 3129 bp  1005    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0054  23S ribosomal RNA segment  99.94 
 
 		 3298 bp  6522    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.26274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0020  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 3044 bp  955    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00975854  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0090  23S ribosomal RNA  83.46 
 
 		 2900 bp  728    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.133955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0056  23S ribosomal RNA  87.35 
 
 		 2908 bp  1122    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000789359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0039  23S ribosomal RNA  87.35 
 
 		 2908 bp  1122    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000978357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0068  23S ribosomal RNA  87.35 
 
 		 2908 bp  1122    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00625643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0059  23S ribosomal RNA  87.35 
 
 		 2908 bp  1122    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0017  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 3592 bp  914    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0004  23S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 3592 bp  918    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  85.42 
 
 		 2933 bp  1015    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  85.42 
 
 		 2932 bp  1015    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0050  23S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 2946 bp  1029    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.074771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0068  23S ribosomal RNA  85.9 
 
 		 2935 bp  940    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.502369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0059  23S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 2935 bp  924    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0882856  normal  0.887302 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0028  23S ribosomal RNA  85.7 
 
 		 2946 bp  1045    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0030  23S ribosomal RNA segment  100 
 
 		 3298 bp  6538    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00296414  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0055  23S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 3129 bp  1005    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639179  decreased coverage  0.00060371 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0067  23S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 2900 bp  735    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 3129 bp  1005    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0009  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2913 bp  955    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00195667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0079  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2913 bp  979    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0026  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 3044 bp  955    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000193882  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0014  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2913 bp  955    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0264747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0082  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 3044 bp  955    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00960446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0038  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2913 bp  955    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000518778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0087  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 3085 bp  955    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0310291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0002  23S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 2609 bp  989    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000051832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0069  23S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 2609 bp  989    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0021  23S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 2609 bp  989    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0006  23S ribosomal RNA  86.38 
 
 		 2969 bp  1061    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0035  23S ribosomal RNA  86.38 
 
 		 2969 bp  1061    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  85.42 
 
 		 2933 bp  1015    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  85.42 
 
 		 2933 bp  1015    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  85.5 
 
 		 2933 bp  1023    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  85.42 
 
 		 2933 bp  1015    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  85.34 
 
 		 2933 bp  1007    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0002  23S ribosomal RNA  85.68 
 
 		 2944 bp  1037    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0115093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0099  23S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 2933 bp  1031    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  85.42 
 
 		 2933 bp  1015    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0036  23S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 2934 bp  963    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0059  23S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 2943 bp  1053    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0010  23S ribosomal RNA  85.68 
 
 		 2944 bp  1037    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0045  23S ribosomal RNA  85.61 
 
 		 2976 bp  920    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.570059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0004  23S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 2900 bp  735    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0063  23S ribosomal RNA  85.8 
 
 		 2976 bp  932    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0042  23S ribosomal RNA  85.7 
 
 		 2936 bp  926    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000650821 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1809  hypothetical protein  100 
 
 		 369 bp  731    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0008  23S ribosomal RNA  86.39 
 
 		 3357 bp  954    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0049  23S ribosomal RNA segment  99.7 
 
 		 3298 bp  6459    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1773  hypothetical protein  99.73 
 
 		 369 bp  724    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0046265  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0031  23S ribosomal RNA  86.39 
 
 		 3357 bp  954    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0064  23S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 2900 bp  735    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0009  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2912 bp  979    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.363949  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0027  23S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 3129 bp  1005    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.344785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0064  23S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 2912 bp  971    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00853635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0020  23S ribosomal RNA  85.6 
 
 		 3062 bp  971    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000158535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0015  23S ribosomal RNA  86.52 
 
 		 2972 bp  1041    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.544354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2999  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2909 bp  957    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3002  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2908 bp  957    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3005  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2908 bp  957    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3008  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2908 bp  957    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3011  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2908 bp  957    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3014  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2908 bp  957    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3017  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2908 bp  957    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3020  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2907 bp  957    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r02  23S ribosomal RNA  85.38 
 
 		 2908 bp  965    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r05  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2908 bp  957    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r08  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2908 bp  957    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r11  23S ribosomal RNA  85.21 
 
 		 2908 bp  950    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r14  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2908 bp  957    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r17  23S ribosomal RNA  85.21 
 
 		 2908 bp  950    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r20  23S ribosomal RNA  85.21 
 
 		 2908 bp  950    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r23  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2908 bp  957    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r25  23S ribosomal RNA  85.38 
 
 		 2907 bp  955    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r29  23S ribosomal RNA  85.3 
 
 		 2907 bp  957    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0011  23S ribosomal RNA  86.94 
 
 		 3529 bp  969    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0016  23S ribosomal RNA  86.94 
 
 		 3088 bp  969    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0021  23S ribosomal RNA  86.94 
 
 		 3260 bp  969    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0060  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 3592 bp  914    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.129555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0093  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 3592 bp  914    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0077  23S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 3592 bp  918    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0051  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 3592 bp  914    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0048  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 3592 bp  914    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0032  23S ribosomal RNA  85.96 
 
 		 3592 bp  918    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.287543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>